当前解析结果
SmilChr07G002218| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002218 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002218 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002218 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 20440219 - 20443540 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993309 |
|---|---|
| GeneID | 130993309 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993309 |
| 原始查询 | SmilChr07G002218 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os10g0509100; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os10g0509100; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G24610 (AT5G24610)cyclic AMP-responsive element-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832532] identity=73.5; qcov=1.01; evalue=6.59e-74; confidence=high |
| Rice | Os10g0509100- identity=71.9; qcov=1; evalue=1.3e-75; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993309 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057774129.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057774129.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057774129.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774129.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774129.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:20441512 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A18,B131,B35,B99 |
Chr7:20441525 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C32,C68 |
Chr7:20441542 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B18,B26,C3,C43 |
Chr7:20441738 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C29 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
8 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。