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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002227`

染色体: Chr07 坐标: 20490648-20493611 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002227`
名称	SmilChr07G002227
描述	uncharacterized SmilChr07G002227
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20490648 - 20493611 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993944`
GeneID	`130993944`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993944`
原始查询	`SmilChr07G002227`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=25.2; qcov=0.806; evalue=7.07e-22; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=35.3; qcov=0.797; evalue=8.09e-42; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993944

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774964.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774964.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774964.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774964.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774964.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20492480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A4,B1,B102,B128,B136,B54,B67,C2,C32,C56,C68,C8
`Chr7:20492488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B108
`Chr7:20492516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B108
`Chr7:20492518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B6
`Chr7:20492520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B108
`Chr7:20492526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B108
`Chr7:20492533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:20492542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B140
`Chr7:20492551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C43,C85
`Chr7:20492566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B108,B112
`Chr7:20492674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:20492698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C19,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774964.1

320 aa

160

320

SWIM

PF04434 SWIM 156-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774964.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	156	185	9.3e-09	35.4	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918981.1
ACCCTGTTGTTTCGTTTATTTTCAATTGGTGGGGTATTTGGAAAAAAAATGATGAAAATGGTGAATGGATGTATGATGGTTATAATCATAAGGAAATAAAAGACACATAGAAAAGTATGACTCTAGATAGAATCATTGGTGAATTTGAGGAATGTTATGGTTCTAAACCTAAGGCAGCCTGGAGCTCCTATCCGGTGGAATATAAGTTGAACCTTGCAAAAATCTCAGCTATCAACAAGAAGGCTGCTCAAGATCTGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993944
ATGACTCTAGATAGAATCATTGGTGAATTTGAGGAATGTTATGGTTCTAAACCTAAGGCAGCCTGGAGCTCCTATCCGGTGGAATATAAGTTGAACCTTGCAAAAATCTCAGCTATCAACAAGAAGGCTGCTCAAGATCTGCTTCAGTACCCTCCTGAGAACTGGTGCAGAGCTTTTCAAAGCTCTAGGTGTTCAACATACATGGTGGACAACAATATCAGTGAGTCCTTTAATGCAAGTATTTCAGATGCTAGACATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774964.1
MTLDRIIGEFEECYGSKPKAAWSSYPVEYKLNLAKISAINKKAAQDLLQYPPENWCRAFQSSRCSTYMVDNNISESFNASISDARHKPIISMLEDIRVIVMSRVRDRKVMVNHWKTEWCPNAIKLFEANKTASMECTVLWNGDYGYEVSDGEDKHIVFVDTIKCTCRLWELSGVPCPHAIAAFYSSSLDPLSVMSHWFHKDMYNKSYEHTIQPVPGKKFWDVKFKDAIEPPPVEKKIGRPKKNRVRAPNEPRLKHKLSRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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