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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002242`

染色体: Chr07 坐标: 20587964-20593264 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002242`
名称	SmilChr07G002242
描述	serine/arginine-rich splicing factor SR34A-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20587964 - 20593264 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993324`
GeneID	`130993324`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993324`
原始查询	`SmilChr07G002242`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/arginine-rich splicing factor SR34A-like
产物	serine/arginine-rich splicing factor SR34A-like
Arabidopsis	`AT3G49430` (SR34a) SER/ARG-rich protein 34A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824105] identity=79.6; qcov=0.757; evalue=7.34e-111; confidence=high
Rice	`Os07g0673500` - identity=70.2; qcov=0.754; evalue=7.1e-94; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:1990904 (ribonucleoprotein complex)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993324

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774140.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	1.00000	`XP_057774140.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057774140.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774140.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774140.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774140.1

273 aa

N

1

136

273

RRM_1

RRM_1

C

PF00076 RRM_1 9-76 aa PF00076 RRM_1 131-193 aa

XP_057774141.1

273 aa

N

1

136

273

RRM_1

RRM_1

C

PF00076 RRM_1 9-76 aa PF00076 RRM_1 131-193 aa

XP_057774142.1

273 aa

N

1

136

273

RRM_1

RRM_1

C

PF00076 RRM_1 9-76 aa PF00076 RRM_1 131-193 aa

XP_057774143.1

273 aa

N

1

136

273

RRM_1

RRM_1

C

PF00076 RRM_1 9-76 aa PF00076 RRM_1 131-193 aa

XP_057774144.1

272 aa

N

1

136

272

RRM_1

RRM_1

C

PF00076 RRM_1 9-76 aa PF00076 RRM_1 131-193 aa

XP_057774145.1

272 aa

N

1

136

272

RRM_1

RRM_1

C

PF00076 RRM_1 9-76 aa PF00076 RRM_1 131-193 aa

XP_057774146.1

272 aa

N

1

136

272

RRM_1

RRM_1

C

PF00076 RRM_1 9-76 aa PF00076 RRM_1 131-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774140.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	9	76	3.4e-32	110.8	RNA recognition motif
`XP_057774140.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	131	193	3.4e-32	110.8	RNA recognition motif
`XP_057774141.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	9	76	3.4e-32	110.8	RNA recognition motif
`XP_057774141.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	131	193	3.4e-32	110.8	RNA recognition motif
`XP_057774142.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	9	76	3.4e-32	110.8	RNA recognition motif
`XP_057774142.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	131	193	3.4e-32	110.8	RNA recognition motif
`XP_057774143.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	9	76	3.4e-32	110.8	RNA recognition motif
`XP_057774143.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	131	193	3.4e-32	110.8	RNA recognition motif
`XP_057774144.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	9	76	3.3e-32	110.9	RNA recognition motif
`XP_057774144.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	131	193	3.3e-32	110.9	RNA recognition motif
`XP_057774145.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	9	76	3.3e-32	110.9	RNA recognition motif
`XP_057774145.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	131	193	3.3e-32	110.9	RNA recognition motif
`XP_057774146.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	9	76	3.3e-32	110.9	RNA recognition motif
`XP_057774146.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	131	193	3.3e-32	110.9	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918157.1
AAAACATTGGGGGTTTATATCCATATTTTGAAAACCACAGCACCCTCCCATCAAAACCGGAAAAAGGAATATAATAGATCCCGGTGCCACAAGGTGAGCCCTAAAGCACGCTAGCAGGGAAGCGAATGCGAAAAATTTGCAAAAGCGCCGCCCAAAAATTACAAAAGAGATTAAGTTGAGGAAACCCTAACCCTACGAGTCGTTGGAGTCTCTGCTTCAGAAAGTTGATTTGCGCGAGGAGTTTCTATTGTCTGTTCGGA...

XM_057918161.1
TCCATATTTTGAAAACCACAGCACCCTCCCATCAAAACCGGAAAAAGGAATATAATAGATCCCGGTGCCACAAGGTGAGCCCTAAAGCACGCTAGCAGGGAAGCGAATGCGAAAAATTTGCAAAAGCGCCGCCCAAAAATTACAAAAGAGATTAAGTTGAGGAAACCCTAACCCTACGAGTCGTTGGAGTCTCTGCTTCAGAAAGTTGATTTGCGCGAGGAGTTTCTATTGTCTGTTCGGAATATTTCTTTGACTTCACC...

CDS

7 records

下载 CDS FASTA

LOC130993324
ATGAGTGGCCGTTTCTCTCGCACTATCTATGTCGGAAACCTTCCTGCTGATATTAGGGAATCAGAAGTCGAAGACTTATTTTACAAGTATGGCCGCATCTTGGATATTGAACTGAAGATTCCACCTCGTCCTCCTTGCTATTGTTTTGTGGAGTTTGAGAATGCCCGGGATGCTGAAGATGCGATAAGGGGCAGAGATGGCTATAACTTTGATGGCTGTCGGTTGAGGGTTGAACTTGCTCATGGTGGCAGAGGACCATC...

LOC130993324
ATGAGTGGCCGTTTCTCTCGCACTATCTATGTCGGAAACCTTCCTGCTGATATTAGGGAATCAGAAGTCGAAGACTTATTTTACAAGTATGGCCGCATCTTGGATATTGAACTGAAGATTCCACCTCGTCCTCCTTGCTATTGTTTTGTGGAGTTTGAGAATGCCCGGGATGCTGAAGATGCGATAAGGGGCAGAGATGGCTATAACTTTGATGGCTGTCGGTTGAGGGTTGAACTTGCTCATGGTGGCAGAGGACCATC...

Protein

7 records

下载 Protein FASTA

XP_057774140.1
MSGRFSRTIYVGNLPADIRESEVEDLFYKYGRILDIELKIPPRPPCYCFVEFENARDAEDAIRGRDGYNFDGCRLRVELAHGGRGPSSSSDRRGGGGGYSERGSGGGGGGGGGSGSGGGRFGVSRHSDYRVIVRGLPSSASWQDLKDHMRKAGDVCFAEVSRDSEGTYGLVDYTNYEDMKYAMRKLDDSEFRNPWTRTYIRVKEYKGSPSRSRSRSRSRSRSPRRRSRSLDRSASRSPSASPVKPSRPRSRSRSRSRSKS...

XP_057774141.1
MSGRFSRTIYVGNLPADIRESEVEDLFYKYGRILDIELKIPPRPPCYCFVEFENARDAEDAIRGRDGYNFDGCRLRVELAHGGRGPSSSSDRRGGGGGYSERGSGGGGGGGGGSGSGGGRFGVSRHSDYRVIVRGLPSSASWQDLKDHMRKAGDVCFAEVSRDSEGTYGLVDYTNYEDMKYAMRKLDDSEFRNPWTRTYIRVKEYKGSPSRSRSRSRSRSRSPRRRSRSLDRSASRSPSASPVKPSRPRSRSRSRSRSKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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