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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002269`

染色体: Chr07 坐标: 20921590-20923564 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002269`
名称	SmilChr07G002269
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 9-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20921590 - 20923564 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993948`
GeneID	`130993948`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993948`
原始查询	`SmilChr07G002269`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 9-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 9-like
Arabidopsis	`AT4G38170` (FRS9) FAR1-related sequence 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829973] identity=29.6; qcov=0.772; evalue=8.85e-29; confidence=low
Rice	`Os12g0160900` - identity=29.9; qcov=0.831; evalue=6.1e-35; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993948

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774969.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774969.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774969.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774969.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774969.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20921593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:20921627`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	55	A1,A11,A16,A21,B1,B106,B108,B110,B111,B115,B117,B119,B120,B122,B124,B125,B128,B131,B132,B139,B20,B21,B24,B25,B33,B36,B38,B39,B4,B41,B57,B58,B6,B60,B67,B74,B77,B81,B85,B88,C14,C15,C20,C27,C39,C53,C61,C64,C66,C67,C7,C72,C75,D10,D3
`Chr7:20921666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C27
`Chr7:20921674`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B28
`Chr7:20921674`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B28
`Chr7:20921691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B45,B54,C50
`Chr7:20921700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A22,B64,B7,B76,C11,C18
`Chr7:20921713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:20921723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:20921769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr7:20921805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B24
`Chr7:20921820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B137,C19,C31,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774969.1

302 aa

151

302

SWIM

PF04434 SWIM 216-235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774969.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	216	235	2.8e-07	30.6	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918986.1
ATGTTGATCGATTTGAATGTTTCTGATGATGGATTGGATGATGAAGAAATTGAGAATGCTTTTGAGGGTAATGAATGTAGCTCGTCTGAAGAGCTTATTGATTCAGATGTGAAGAGTGAGGCATTTAAGGCAGTAAGAAATGAAATTGGGGATAAATTGCAGACAATGGTTACTGATTATGATTTAAGTGAGAATCGATGGTTTTGGAACATGTACAATTTGAGAAAACGGTGGGCTTCTGTTTTTACCAACGAGAAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993948
ATGTTGATCGATTTGAATGTTTCTGATGATGGATTGGATGATGAAGAAATTGAGAATGCTTTTGAGGGTAATGAATGTAGCTCGTCTGAAGAGCTTATTGATTCAGATGTGAAGAGTGAGGCATTTAAGGCAGTAAGAAATGAAATTGGGGATAAATTGCAGACAATGGTTACTGATTATGATTTAAGTGAGAATCGATGGTTTTGGAACATGTACAATTTGAGAAAACGGTGGGCTTCTGTTTTTACCAACGAGAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774969.1
MLIDLNVSDDGLDDEEIENAFEGNECSSSEELIDSDVKSEAFKAVRNEIGDKLQTMVTDYDLSENRWFWNMYNLRKRWASVFTNEKFTAGLHATSRSKVTNKVLKDLCSATTSLHEFVIQYERLQHEWRLRESEEDTMCRGVPGQFIQNNNLLKHAASVYTRNVYKTFECEVTHSLNVKIMQHPYDFSADALVYAVSSSSSSNGIRTIHFRRPTRHASCSCQMWEAEGILCRHILNIMLLLNIDSLPAQFILYRWRKDAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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