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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002277`

染色体: Chr07 坐标: 21012011-21016553 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002277`
名称	SmilChr07G002277
描述	uncharacterized SmilChr07G002277
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21012011 - 21016553 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993360`
GeneID	`130993360`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993360`
原始查询	`SmilChr07G002277`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835432]; symbol=AT5G53500; hit=AT5G53500; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835432]; symbol=AT5G53500; hit=AT5G53500; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G53500` (AT5G53500) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835432] identity=55.8; qcov=0.781; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0115400` (OsWD40-60) - identity=49.3; qcov=0.739; evalue=1.85e-166; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993360

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057774198.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057774198.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057774198.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774198.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774198.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21012914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,D10
`Chr7:21012948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,C60
`Chr7:21013187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,A9,B69,B72,C4
`Chr7:21013366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:21013652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B15,C51
`Chr7:21014469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr7:21015268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:21015543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B87
`Chr7:21015561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A20,A8,B3,B88
`Chr7:21015663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B70,C40,C55,D11
`Chr7:21015723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C11,C25,C69,D10
`Chr7:21015771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774198.1

686 aa

343

686

WD40

PF00400 WD40 246-278 aa PF00400 WD40 346-381 aa PF00400 WD40 387-424 aa PF00400 WD40 533-558 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774198.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	246	278	3.1e-34	116.6	WD domain, G-beta repeat
`XP_057774198.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	346	381	3.1e-34	116.6	WD domain, G-beta repeat
`XP_057774198.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	387	424	3.1e-34	116.6	WD domain, G-beta repeat
`XP_057774198.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	533	558	3.1e-34	116.6	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918215.1
TAGTACGCACAAAAACTGAGCCCAAAATCTCGTTTCTCGGGCCATCCATATTCACGGATATCGAGAATTTATGCCTTTTTTCCTTTTTCCATCATAACTTTCTTCCTCACCACAATCCAATCCATCAATTTCCCATTAATTCCAAATTATCCCCTTTTACCAATTGCTTTTTAATGGTCACTCGTCTTCGTTGCTTCCGTTTGTAAAGAGCCAGCCACTCCCTCGACCTCGACCTCGACCTCGATCTCTCACCCCTTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993360
ATGGATAGCTTCACCAACGACGAGGAATCTCAATTTTTTGACGCGCTGGAGCACATTGGTGAAGAGCCAAAATTTAGGAATTGGGAATATGATGTGTGGATTAATGCTCCACAGAGTGTCGGTGAGCGCCGTGAGAATTTTTTAAGGGAGATTGGGATCAGCATAGGTGAGGTGGAGAGAGAAGCTGTAGATAGTTGTCATGATAGTGATATGAGTATGAGGGGAGATATTGAAAGAGTTATGGAGGATAGTGGCGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774198.1
MDSFTNDEESQFFDALEHIGEEPKFRNWEYDVWINAPQSVGERRENFLREIGISIGEVEREAVDSCHDSDMSMRGDIERVMEDSGAVLRSEDEFSSSRSSVSSWDTDDLGLCRNGDGNLSGGCGFECDMGGMVENESRGDTQLMGLEWLLSSGGLDSASQLPCTVDEIWDRGNEASVNTSRTRSNLRKRLLRRLRSMTCMMSGGMKEENVGSCVFGQVQGSRIWRVRVRHCQRRLKELSALFTGQEIQAHEGPITAMKFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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