当前解析结果
SmilChr07G002290| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002290 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002290 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002290 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 21181359 - 21184596 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993369 |
|---|---|
| GeneID | 130993369 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993369 |
| 原始查询 | SmilChr07G002290 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0597300- identity=28.7; qcov=0.872; evalue=4.89e-11; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993369 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057774217.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057774217.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774217.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774217.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057774217.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:21181830 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A18,B35,B99,D7 |
Chr7:21181874 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,B56,B96,C82 |
Chr7:21181929 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A24,A7,B94,C8,C80 |
Chr7:21181963 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B137,C39,C83 |
Chr7:21181988 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B104,B70,C55 |
Chr7:21182011 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B1,B104,B70,C32,C40,C55,C68 |
Chr7:21182015 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B113 |
Chr7:21182016 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B70,B93,C55 |
Chr7:21182022 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B102,B107,B15,B62,C51,C52,C61 |
Chr7:21182046 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 114 | A1,A11,A16,A18,A19,A2,A23,A24,A4,A6,A7,B1,B100,B104,B105,B108,B109,B110,B114,B121,B124,B125,B128,B129,B130,B131,B135,B136,B139,B140,B15,B18,B19,B2,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B32,B35,B37,B40,B42,B43,B44,B45,B54,B59,B61,B62,B64,B65,B66,B71,B74,B75,B76,B83,B87,B88,B9,B90,B91,B93,B94,B97,B99,C10,C12,C14,C16,C18,C19,C22,C28,C29,C3,C31,C32,C37,C39,C43,C47,C48,C50,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C7,C72,C74,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D10,D11,D2,D4,D7 |
Chr7:21182050 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B123,C73 |
Chr7:21182093 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C61 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。