当前解析结果
SmilChr07G002296| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002296 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002296 |
| 描述 | GDSL esterase/lipase At4g10955-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 21250101 - 21251897 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993374 |
|---|---|
| GeneID | 130993374 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993374 |
| 原始查询 | SmilChr07G002296 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | GDSL esterase/lipase At4g10955-like |
| 产物 | GDSL esterase/lipase At4g10955-like |
| Arabidopsis | AT5G24230 (AT5G24230)Lipase class 3-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832490] identity=49.6; qcov=1.06; evalue=1.51e-109; confidence=high |
| Rice | Os02g0286200- identity=48; qcov=1.03; evalue=7.07e-114; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993374 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057774221.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057774221.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057774221.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774221.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774221.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:21250323 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C19 |
Chr7:21250637 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A24,A7,B94,C80 |
Chr7:21250667 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B121,B129 |
Chr7:21250670 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A20,C11,C54,C69,C75 |
Chr7:21250793 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B117,D11 |
Chr7:21250825 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B117 |
Chr7:21251187 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A2,B56,B96,C82,D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。