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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002299`

染色体: Chr07 坐标: 21281059-21282464 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002299`
名称	SmilChr07G002299
描述	uncharacterized protein At5g43822-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21281059 - 21282464 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993378`
GeneID	`130993378`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993378`
原始查询	`SmilChr07G002299`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OSJNBa0057L21.18; symbol=OSJNBa0057L21.18; hit=Os10g0566900; species=rice; confidence=medium
产物	OSJNBa0057L21.18; symbol=OSJNBa0057L21.18; hit=Os10g0566900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G43822` (AT5G43822) Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922354] identity=46.9; qcov=0.628; evalue=4.33e-21; confidence=medium
Rice	`Os10g0566900` (OSJNBa0057L21.18) - identity=54.2; qcov=0.643; evalue=3.09e-27; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF15011 (CA109-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993378

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057774228.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057774228.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774228.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774228.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774228.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21281448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr7:21281493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr7:21281495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr7:21281507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C42
`Chr7:21281620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr7:21281648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B28,B55,B63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774228.1

129 aa

129

CA109-like

PF15011 CA109-like 3-82 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774228.1`	Pfam	`PF15011`	CA109-like	Domain	3	82	3.1e-22	79.9	Ribosome biogenesis protein C1orf109-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918245.1
AGAATGTGGAAGAAAACGGAAAAAGGAAAAATAATTGTGAGTGGGTTGGTCTCGTAGTGCATTGGCTCATTGTGTGTGATTAGGGGTGGAAAATCGGGTTGCGGGTATCGGGTATACCCTCACCCGTCCCGATACCCGCGCGGGTATCGGGTACCCGATACCCGCAAAATTCGGGTGGAGGGTCGGGTGCGGGTATTGCATCCTCGAAAATTGCGGGTAGAGGGTACCCTCGGGTATACCCGCGGATACCCGCACTACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993378
ATGGACTCAATAGTGAAAAAATATCAGCAACGATTTCAGAAAATTAGGGAGGAGATGAACCGGTGGGAAGAGCTCCAGTCTCAGCTGATTTCCCAATTCTCTAATGCATCTTCCATCATCAAGAGGTTGCAGGTTATCCGAGATTCGCAAAACTATGGAGCTTTGAGATGTGTTGAGGGCATAGAAAGTGTTTTGTTGGCAAAACAGATGGATTCCCTCCAAATCATCTTCGTCTCCATCAAAAAATCGCGGGACTGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774228.1
MDSIVKKYQQRFQKIREEMNRWEELQSQLISQFSNASSIIKRLQVIRDSQNYGALRCVEGIESVLLAKQMDSLQIIFVSIKKSRDCEGTLIPAAGIRCGYSGTRIGEEGRVRVPFSAVFVPRRKMLMDE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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