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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002300`

染色体: Chr07 坐标: 21313817-21317402 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002300`
名称	SmilChr07G002300
描述	uncharacterized SmilChr07G002300
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21313817 - 21317402 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993379`
GeneID	`130993379`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993379`
原始查询	`SmilChr07G002300`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CRCT; symbol=CRCT; hit=Os05g0595300; species=rice; confidence=high
产物	CRCT; symbol=CRCT; hit=Os05g0595300; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G53420` (AT5G53420) CCT motif family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835423] identity=53.1; qcov=0.976; evalue=6.46e-75; confidence=high
Rice	`Os05g0595300` (CRCT) - identity=51.5; qcov=1.05; evalue=2.92e-76; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0009909 (regulation of flower development)
KEGG	-
Pfam	PF06203 (CCT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993379

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774229.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057774231.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057774231.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774229.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774229.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21315998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr7:21316359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C14
`Chr7:21317048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B42,B43,B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774230.1

288 aa

144

288

CCT

PF06203 CCT 237-279 aa

XP_057774232.1

247 aa

124

247

CCT

PF06203 CCT 196-238 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774230.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	237	279	1.6e-17	63.9	CCT motif
`XP_057774232.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	196	238	7.8e-18	65.0	CCT motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918247.1
AGAGCACACTAGCCATTTCCACTACCCACAATGTCCCCCAAAATGCACAAAAAAACATCCGAGCATCATCGAACAACTAATTATTTGTCAAAATATATTTAGATAACCATTTTCAGTTTACTTGCTTTATTACTTTCTTTTAACCTTTTCAACTCTTACAATTTTCTTTCTCATGATGAAAGAGTCCAATCCAAGACCCAACCAAAATCAGATTCTTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTCCTTTACGGCTGTTACTGTCGCTG...

XM_057918246.1
TTTCTTTCTCATGATGAAAGAGTCCAATCCAAGACCCAACCAAAATCAGATTCTTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTCCTTTACGGCTGTTACTGTCGCTGCTTCTGCTGTTATTTCCCACTGTTTGACACCTATAAAAAGACCTTGCCTCCATTAAAGCAATTCTCCTCTATCTATACTTACACTTAGATACAGAGTTCGGTGCGTCTTGTTCTCTCTCTCCTTCCCCTAATCTTTTGAGTGACAAATTTGAGAGAAACAGT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130993379
ATGTCTGCAGAAGCTGGGCTTATGTTCCCGTACTTCCAGAACTTCTCTCTAGAAGTTCAGCAGTTTGATGACTTTTGCTGCTCACAAAGGCCTAATTCGTCCTTGGGTATACCAAGCAGCCTCATGCAAACATCCACCATATCAGATTACAACCTTGGGGGAGAAGGTGATCTGTTCAAGGCACCTGAACCAGTGATCAGAGAACCATTAATGGGTGTGGATCCAATGACGGCTGCTATCTCAATGATCTCTTGTGGAGA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057774229.1
MSAEAGLMFPYFQNFSLEVQQFDDFCCSQRPNSSLGIPSSLMQTSTISDYNLGGEGDLFKAPEPVIREPLMGVDPMTAAISMISCGEDVISPQSLTVSDIESSIESGQLLSEVFYECRKDLLAQQGNEMPLFEALSIKIPPLQIDENFAVDEKLLAEGALQKSISSSCLGSMDSVHEAPLRPRFLDFPVLDFGAFNGMRRAFSEGDIKTLGNDGNISLEQSPMVQPRTISSCPSEDRREKLSRYWNKKSKRNFGRKIKVG...

XP_057774230.1
MSAEAGLMFPYFQNFSLEVQQFDDFCCSQRPNSSLGIPSSLMQTSTISDYNLGGEGDLFKAPEPVIREPLMGVDPMTAAISMISCGEDVISPQSLTVSDIESSIESGQLLSEVFYECRKDLLAQQGNEMPLFEALSIKIPPLQIDENFAVDEKLLAEGALQKSISSSCLGSMDSVHEAPLRPRFLDFPVLDFGAFNGMRRAFSEGDIKTLGNDGNISLEQSPMVQPRTISSCPSEDRREKLSRYWNKKSKRNFGRKIKYA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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