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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002304`

染色体: Chr07 坐标: 21326660-21328768 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002304`
名称	SmilChr07G002304
描述	rust resistance kinase Lr10-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21326660 - 21328768 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993384`
GeneID	`130993384`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993384`
原始查询	`SmilChr07G002304`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rust resistance kinase Lr10-like
产物	rust resistance kinase Lr10-like
Arabidopsis	`AT1G66920` (AT1G66920) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843010] identity=29; qcov=1.03; evalue=1.4e-59; confidence=low
Rice	`Os01g0115600` (OsRLCK11) - identity=31.4; qcov=1.06; evalue=6.83e-74; confidence=low
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF13947 (GUB_WAK_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993384

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057774239.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774239.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774239.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774239.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774239.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21326785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	177	A1,A11,A13,A15,A16,A18,A2,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A8,B1,B100,B102,B107,B108,B11,B110,B111,B112,B115,B117,B119,B12,B121,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B138,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B29,B3,B31,B32,B33,B35,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B49,B5,B50,B54,B55,B56,B58,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B70,B72,B73,B74,B75,B76,B79,B83,B86,B87,B89,B9,B90,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C16,C17,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C48,C49,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C73,C74,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C85,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr7:21326962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:21327127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B88,C14
`Chr7:21327127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C14
`Chr7:21327168`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B102,B107,B15,B5,B62,C39,C51
`Chr7:21327182`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B35
`Chr7:21327182`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B35
`Chr7:21328328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:21328560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774239.1

572 aa

286

572

GUB_WAK_bind

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF13947 GUB_WAK_bind 21-98 aa PF00069 Pkinase 323-550 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 323-552 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774239.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	21	98	1.2e-12	48.7	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding
`XP_057774239.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	323	550	9.8e-17	61.9	Protein kinase domain
`XP_057774239.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	323	552	1.2e-18	68.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918256.1
TTAATTATTTATTCAATCATTCTAGATAGGAATCTTGAAAAGGAGTTAAGTAAGATGAAGATGATCAATGGAAAGTAGCAAGACAATACACCATATTTCAAATAGAATTCATATTAGACATGAAAATTTTCCTTCTTACCTTCATCTCCATCATCTACCTTGCTGTAGGCCAAGATGAGTGCCTCCCAGCAACATGTGGCCCTTATGCGCCCGTTGTACGTTTCCCGTTCTGGCTAAAAGGTCACCAACCGGAGCGCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993384
ATGAAAATTTTCCTTCTTACCTTCATCTCCATCATCTACCTTGCTGTAGGCCAAGATGAGTGCCTCCCAGCAACATGTGGCCCTTATGCGCCCGTTGTACGTTTCCCGTTCTGGCTAAAAGGTCACCAACCGGAGCGCTGTGGATACCCGGGCTTCGGCTTGTCATGCAACGGAAGCAGAGCAGATCTTGATCTTCAATTCCCAGTGACAGCATCAGCCACAAATATCATGCTCCCATTAAACATGACAGTTGCAGTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774239.1
MKIFLLTFISIIYLAVGQDECLPATCGPYAPVVRFPFWLKGHQPERCGYPGFGLSCNGSRADLDLQFPVTASATNIMLPLNMTVAVWNIDYKAQKMLVNYARARSCLPRKLPTLNSSASPIFEAEAIGYGEGSTLFNCSNTRNYETVACLSSSRYQVLDFASMYDISSLPPYSSCFKMYNISYVPDRALTGGDDESGTRFYLKWSRPSCGKCEAKGNYCRLQNSAAAAETECFSPQHGTNTTGALTNHKPLAAGITAGII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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