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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002314`

染色体: Chr07 坐标: 21418686-21423775 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002314`
名称	SmilChr07G002314
描述	polypyrimidine tract-binding protein homolog 2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21418686 - 21423775 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993395`
GeneID	`130993395`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993395`
原始查询	`SmilChr07G002314`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polypyrimidine tract-binding protein homolog 2
产物	polypyrimidine tract-binding protein homolog 2
Arabidopsis	`AT5G53180` (PTB2) polypyrimidine tract-binding protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835399] identity=83.7; qcov=0.718; evalue=4.25e-146; confidence=high
Rice	`Os08g0436000` - identity=61.1; qcov=0.889; evalue=2.73e-115; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0043484 (regulation of RNA splicing)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF11835 (RRM_8); PF13893 (RRM_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993395

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774253.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057774253.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774254.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057774254.1`
5	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057774254.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21419227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:21420300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr7:21422695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,A5,B40,C87
`Chr7:21422938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C19,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774253.1

433 aa

216

433

RRM_1

RRM_8

RRM_1

PF00076 RRM_1 22-73 aa PF11835 RRM_8 242-320 aa PF00076 RRM_1 249-308 aa

XP_057774254.1

334 aa

167

334

RRM_5

RRM_8

RRM_1

PF13893 RRM_5 133-228 aa PF11835 RRM_8 143-221 aa PF00076 RRM_1 150-209 aa

XP_057774255.1

333 aa

166

333

RRM_5

RRM_8

RRM_1

PF13893 RRM_5 132-227 aa PF11835 RRM_8 142-220 aa PF00076 RRM_1 149-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774253.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	22	73	1.8e-22	79.7	RNA recognition motif
`XP_057774253.1`	Pfam	`PF11835`	RRM_8	Domain	242	320	2.1e-11	44.6	RRM-like domain
`XP_057774253.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	249	308	1.8e-22	79.7	RNA recognition motif
`XP_057774254.1`	Pfam	`PF13893`	RRM_5	Domain	133	228	3.8e-07	30.6	RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain)
`XP_057774254.1`	Pfam	`PF11835`	RRM_8	Domain	143	221	1.9e-08	35.1	RRM-like domain
`XP_057774254.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	150	209	2.7e-11	43.9	RNA recognition motif
`XP_057774255.1`	Pfam	`PF13893`	RRM_5	Domain	132	227	3.3e-07	30.8	RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain)
`XP_057774255.1`	Pfam	`PF11835`	RRM_8	Domain	142	220	1.9e-08	35.1	RRM-like domain
`XP_057774255.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	149	208	2.7e-11	43.9	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918270.1
AGCCACGCAAAATCTATTCTATCCCTTTCTGCCAACTTCCGCAACTGTACCCCTTTTCACCGTTAATAATCCCCAAATATTGTATAACAAAAATTTCTCGCTTTCGATCTGCTCTTCTACCCTCCCCGAACCCTAATTTCACCGTTTCTCTCTCAGCTCGGAATGTCATCAGTGTCCAGCCAGCCGCAGTTTCGGTATACCCAACCTCCGTCCAAGGTTCTCCATTTAAGGAATTTACCATGGGAATGTACTGAAGAGGA...

XM_057918272.1
GCTGGGGAAGCCATTTGGTAAGGTTGTCAACACAAAGTGTAATGTTGGAGCAAATAGGAACCAAGCTTTTATTGAGTTTGCAGAACTAAATCAAGCTATTGCTATGATATCATATTATGCATCATCATCTGAGCCTGCTCAGATGTTGCTGGAAATGTACTCTTGGTAACAATTGAGGGAAATGATGCACGTCTTGTCAGTATTGATGTCCTACACTTGGAACATGCCAAGGAAATATCTTCGATGGCAGCTTATTGCAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130993395
ATGTCATCAGTGTCCAGCCAGCCGCAGTTTCGGTATACCCAACCTCCGTCCAAGGTTCTCCATTTAAGGAATTTACCATGGGAATGTACTGAAGAGGAATTGGTCGAGCTGGGGAAGCCATTTGGTAAGGTTGTCAACACAAAGTGTAATGTTGGAGCAAATAGGAACCAAGCTTTTATTGAGTTTGCAGAACTAAATCAAGCTATTGCTATGATATCATATTATGCATCATCATCTGAGCCTGCTCAGGTACGAGGGAA...

LOC130993395
ATGATGCACGTCTTGTCAGTATTGATGTCCTACACTTGGAACATGCCAAGGAAATATCTTCGATGGCAGCTTATTGCATTGGGAGAAAGAGCGCATGTATTTTCAGCCTTTGGGTTCGTTCATAAAATTACAACTTTTGAGAAGACTGCTGGGTTTCAGGCTCTGGTGCAATTTTCAGATTCAGAGACTGCCTCTGCTGCCAAGGATGCTCTTGATGGTAGAAGCATACCAAGGTATTTGATTCCAGAGCTGGGGCCGTG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057774253.1
MSSVSSQPQFRYTQPPSKVLHLRNLPWECTEEELVELGKPFGKVVNTKCNVGANRNQAFIEFAELNQAIAMISYYASSSEPAQVRGKTVYLQYSNRQEIVNNKTTADVAGNVLLVTIEGNDARLVSIDVLHLVFSAFGFVHKITTFEKTAGFQALVQFSDSETASAAKDALDGRSIPRYLIPELGPCSLRITYSAHTDLSVKFQSHRSRDYTNPLLPVAPSAIDASGQFSLGVDGKKMEPESNVLLASIENMQYAVTLDV...

XP_057774254.1
MMHVLSVLMSYTCRNMPRKYLRWQLIALGERAHVFSAFGFVHKITTFEKTAGFQALVQFSDSETASAAKDALDGRSIPRYLIPELGPCSLRITYSAHTDLSVKFQSHRSRDYTNPLLPVAPSAIDASGQFSLGVDGKKMEPESNVLLASIENMQYAVTLDVLQTVFSSFGPVLKIAMFDKNGGLQALIQYPDVQTAVVAKEALEGHCIYDGGYCKLHISYSRHTDLSIKVNNDRSRDYTIPNTPVLNSQPSILGQQPYNV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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