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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002317`

染色体: Chr07 坐标: 21435385-21437297 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002317`
名称	SmilChr07G002317
描述	transcription factor SPEECHLESS-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21435385 - 21437297 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993397`
GeneID	`130993397`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993397`
原始查询	`SmilChr07G002317`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor SPEECHLESS-like
产物	transcription factor SPEECHLESS-like
Arabidopsis	`AT5G53210` (SPCH) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835402] identity=57.8; qcov=0.978; evalue=4.03e-86; confidence=high
Rice	`Os06g0526100` (OsbHLH054) - identity=50.9; qcov=0.967; evalue=8.72e-69; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0010052 (guard cell differentiation); GO:0010374 (stomatal complex development); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00010 (HLH); PF22754 (bHLH-TF_ACT-like_plant)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993397

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774256.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774256.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774256.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774256.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774256.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21435935`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A24,A4,A7,B120,B127,B25,B30,B48,B6,B63,B83,B84,C11,C13,C25,C35,C40,C50,C56,C69,C81,D8
`Chr7:21436269`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B29
`Chr7:21436269`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B29
`Chr7:21437021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B113,C46,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774256.1

280 aa

140

280

HLH

PF00010 HLH 62-112 aa

XP_057774257.1

276 aa

138

276

HLH

bHLH-TF_ACT-like_plant

PF00010 HLH 62-112 aa PF22754 bHLH-TF_ACT-like_plant 219-274 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774256.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	62	112	6.2e-13	49.1	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057774257.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	62	112	6.1e-13	49.1	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057774257.1`	Pfam	`PF22754`	bHLH-TF_ACT-like_plant	Domain	219	274	2e-05	25.3	Plant bHLH transcription factor, ACT-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918274.1
CACTTTTCCTAACGTTTCCGCCGATGCTGACTGTTCCGTCCCTTTCTACTCCCTCCCACCTCTCCTTACCTTAATTAATTACTCCTTTTCGACCCGACCTCTAATTCTTCATTCTTCACTCTTCACATCCATGGATGCTGAAACATTCTTCGACGATACCGATATCTTCAGCGTTCTCGAAGCATGGGAGAACGAGAGCTTCCACTTCCAAACCTCGCCCTCCATTCTTAAGAGACCTGCCGAGGTGGAGGCCGAGCTCG...

XM_057918273.1
CACTTTTCCTAACGTTTCCGCCGATGCTGACTGTTCCGTCCCTTTCTACTCCCTCCCACCTCTCCTTACCTTAATTAATTACTCCTTTTCGACCCGACCTCTAATTCTTCATTCTTCACTCTTCACATCCATGGATGCTGAAACATTCTTCGACGATACCGATATCTTCAGCGTTCTCGAAGCATGGGAGAACGAGAGCTTCCACTTCCAAACCTCGCCCTCCATTCTTAAGAGACCTGCCGAGGTGGAGGCCGAGCTCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993397
ATGGATGCTGAAACATTCTTCGACGATACCGATATCTTCAGCGTTCTCGAAGCATGGGAGAACGAGAGCTTCCACTTCCAAACCTCGCCCTCCATTCTTAAGAGACCTGCCGAGGTGGAGGCCGAGCTCGACGCCGACGCCTGCAAGCGCCACAAGCTCACTGAAGAAGCTGCCGGCCACAACAAAGTGTCGCACATCACCGTCGAGAGAAACCGCCGGAAGCAAATGAACGAGCATCTCTCCGTGCTTCGCTCCTTGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774256.1
MDAETFFDDTDIFSVLEAWENESFHFQTSPSILKRPAEVEAELDADACKRHKLTEEAAGHNKVSHITVERNRRKQMNEHLSVLRSLMPCFYVKRGDQASIIGGVVDYINELQQVLQSLEAKKQRKAAYNEVVVSPGPRIVSSPRLSPRTPQPQPSSPYNYKPWSLPSPVDPSPSNSSTSSSINDAVNELVATSKSPIAQVEVKFSGPNLLLKTASHRIPGQVLKIISALEQLALEILHVSISTLDHAMLNSFTIKVINAT...

XP_057774257.1
MDAETFFDDTDIFSVLEAWENESFHFQTSPSILKRPAEVEAELDADACKRHKLTEEAAGHNKVSHITVERNRRKQMNEHLSVLRSLMPCFYVKRGDQASIIGGVVDYINELQQVLQSLEAKKQRKAAYNEVVVSPGPRIVSSPRLSPRTPQPQPSSPYNYKPWSLPSPVDPSPSNSSTSSSINDAVNELVATSKSPIAQVEVKFSGPNLLLKTASHRIPGQVLKIISALEQLALEILHVSISTLDHAMLNSFTIKIGIQC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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