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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002334`

染色体: Chr07 坐标: 21640900-21647078 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002334`
名称	SmilChr07G002334
描述	plastidial pyruvate kinase 2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21640900 - 21647078 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993411`
GeneID	`130993411`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993411`
原始查询	`SmilChr07G002334`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plastidial pyruvate kinase 2-like
产物	plastidial pyruvate kinase 2-like
Arabidopsis	`AT5G52920` (PKP-BETA1) plastidic pyruvate kinase beta subunit 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835369] identity=79.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0571200` - identity=76.7; qcov=0.835; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004743 (pyruvate kinase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006096 (glycolytic process); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0030955 (potassium ion binding)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00224 (PK); PF02887 (PK_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993411

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057774273.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057774273.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057774273.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774273.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774273.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21641342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr7:21644280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,C73,D3
`Chr7:21646639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B122,B55,C1
`Chr7:21646694`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C71
`Chr7:21646694`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C71
`Chr7:21646747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr7:21646817`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B33
`Chr7:21646817`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774273.1

576 aa

288

576

PK_C

PF00224 PK 107-427 aa PF02887 PK_C 468-556 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774273.1`	Pfam	`PF00224`	PK	Domain	107	427	2.6e-110	369.3	Pyruvate kinase, barrel domain
`XP_057774273.1`	Pfam	`PF02887`	PK_C	Domain	468	556	2.5e-19	70.2	Pyruvate kinase, alpha/beta domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918290.1
CAGTTCTGCCCCCCTTTAAACCCCCACCCTAACTGTTTTGGACACAGTTTAAAGCTTAGCCACCATTTTTCTCTTTCTTCGATTTTCGATACAAACGAGACAACCCCCAACACAACCTCCAAATTTATCGGCGATTTTTCCAATCTCCCTCTCATTTTATACTCGTTTCTTCTTCTCATTGCCTCTAACTCTCTCTACTCTCTCCAGCATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTGTCTCTCTCTGAGCCTTTTGCGGCGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993411
ATGGCGCAAGTGGTGGCGACGCGACTGATTCATGTTTCATTGGTGGCCAATCCTGGCTCTGGCTCTCCACAGAGCTGCGCGGAGAAGCTGAAGCCGGGGTGTGGCTTCAAAGCTAAAGTTTTGGCTCAAACAGAGAGGAGGAGGAGCCGCGGAGCACTGCACGTCAGCGCGCCGATCGTGGCGAGGAGATCTGCTACGGAAGTGATTCCGGTGTCTCCTGAAGACGTAACCAAGGCTGCAATGCAAAATCAGTATTCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774273.1
MAQVVATRLIHVSLVANPGSGSPQSCAEKLKPGCGFKAKVLAQTERRRSRGALHVSAPIVARRSATEVIPVSPEDVTKAAMQNQYSQVIPQLGDTSVGVWLKPMVRRKTKIVCTIGPSTDTKEMIWKLAEAGMNVARLNMSHGDHASHQKVIDLVKEYNAQVKDNVIAIMLDTKGPEVRSGDLPQPITLVPGQEFTFTIQRGVGTADCVSVNYDDFVNDVEDGDMLLVDGGMMSFLVKSKNEDSVKCEVVDGGELKSRRH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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