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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002342`

染色体: Chr07 坐标: 21760364-21761745 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002342`
名称	SmilChr07G002342
描述	uncharacterized SmilChr07G002342
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21760364 - 21761745 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993956`
GeneID	`130993956`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993956`
原始查询	`SmilChr07G002342`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=53.9; qcov=0.34; evalue=2.33e-33; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=42.9; qcov=1.06; evalue=5.7e-122; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993956

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774979.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057774979.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774979.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774979.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774979.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21760475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr7:21760494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B52
`Chr7:21760531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr7:21760534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr7:21760723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	86	A1,A10,A11,A13,A16,A23,A4,A5,A6,A8,B1,B100,B102,B107,B11,B110,B113,B131,B132,B133,B134,B135,B16,B17,B18,B19,B2,B23,B24,B26,B29,B3,B32,B40,B41,B42,B43,B45,B46,B54,B55,B61,B64,B7,B73,B74,B75,B86,B87,B9,B90,B92,B95,B97,C17,C21,C22,C27,C30,C32,C37,C38,C43,C49,C5,C51,C53,C62,C63,C64,C66,C68,C74,C76,C78,C79,C8,C80,C82,C85,C87,C9,D1,D2,D4,D9
`Chr7:21760739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B108,C32,C82
`Chr7:21760740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr7:21760845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C17,C38,C60
`Chr7:21760846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,D3
`Chr7:21760853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr7:21760885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C62,D6
`Chr7:21760931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774979.1

421 aa

210

421

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 80-119 aa PF04827 Plant_tran 187-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774979.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	80	119	4.6e-19	68.6	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057774979.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	187	354	6e-74	248.8	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918996.1
TTCCACTCTTAAAAAAAATGTCTTCATCCACCAATTCTTCCAACAATAATTCTTCCTCAAATTCTTCATCCGACGAAGAAGTTCATGTTGATCCCGCACAACTTCCTCCTCTTCCCGATCCTACTCAAGCCCCCGATTTATTTTTTATGAGATGTGCTGTGAATTTTATGCAAGTGGCAAGTTCATATCGGTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGACGAAAAAGCGGGCAGTGGTTCGTCATGACCGTGAAGGTGGTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993956
ATGTCTTCATCCACCAATTCTTCCAACAATAATTCTTCCTCAAATTCTTCATCCGACGAAGAAGTTCATGTTGATCCCGCACAACTTCCTCCTCTTCCCGATCCTACTCAAGCCCCCGATTTATTTTTTATGAGATGTGCTGTGAATTTTATGCAAGTGGCAAGTTCATATCGGTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGACGAAAAAGCGGGCAGTGGTTCGTCATGACCGTGAAGGTGGTGGCGAGCGCCTCCATCGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774979.1
MSSSTNSSNNNSSSNSSSDEEVHVDPAQLPPLPDPTQAPDLFFMRCAVNFMQVASSYRFDPPPPRPTKKRAVVRHDREGGGERLHRDYFAVEPVYGPQFFRRRFRMSRELFLRIVNALEVDPYFQQRQDAVGRLSFSPIQKCTAAVRQLAYGTSADCCDEYLRIGESTALECLKKFCKAVIRIFGGTYLRRPTTADVQRITAMHEARHGFPGMLGSLDCMHWGWKNCPVAWHGAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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