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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002350`

染色体: Chr07 坐标: 21817034-21822704 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002350`
名称	SmilChr07G002350
描述	tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase 2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21817034 - 21822704 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993424`
GeneID	`130993424`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993424`
原始查询	`SmilChr07G002350`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase 2
产物	tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase 2
Arabidopsis	`AT5G25480` (DNMT2) DNA methyltransferase-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832623] identity=63.4; qcov=0.97; evalue=1.13e-154; confidence=high
Rice	`Os01g0612000` (OsDNMT2) - identity=56.5; qcov=0.678; evalue=2.46e-83; confidence=high
GO	GO:0008168 (methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00145 (DNA_methylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993424

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774286.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057774286.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057774288.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057774288.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057774286.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21817606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,C40,C55
`Chr7:21817608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D10
`Chr7:21818523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,C31,C4,D7
`Chr7:21819748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr7:21819802`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B17
`Chr7:21819802`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B17
`Chr7:21820371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B6
`Chr7:21820418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr7:21820819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B22,B42,B43,B76
`Chr7:21821335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B70,C40,C50,C55
`Chr7:21822480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C34,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774286.1

452 aa

226

452

DNA_methylase

PF00145 DNA_methylase 82-443 aa

XP_057774287.1

452 aa

226

452

DNA_methylase

PF00145 DNA_methylase 82-443 aa

XP_057774288.1

383 aa

192

383

DNA_methylase

PF00145 DNA_methylase 82-249 aa

XP_057774289.1

363 aa

182

363

DNA_methylase

PF00145 DNA_methylase 18-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774286.1`	Pfam	`PF00145`	DNA_methylase	Domain	82	443	7.5e-35	121.6	C-5 cytosine-specific DNA methylase
`XP_057774287.1`	Pfam	`PF00145`	DNA_methylase	Domain	82	443	7.5e-35	121.6	C-5 cytosine-specific DNA methylase
`XP_057774288.1`	Pfam	`PF00145`	DNA_methylase	Domain	82	249	1.7e-24	87.6	C-5 cytosine-specific DNA methylase
`XP_057774289.1`	Pfam	`PF00145`	DNA_methylase	Domain	18	354	5.4e-29	102.4	C-5 cytosine-specific DNA methylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918305.1
TCAATCTTAAATCTAATGTCATTCAACGTATCCTAATTCCTAAAGCTATTGAGATTTCTGCCTGGCGCCGCTCATCTCGTCCAGTCCACCACCGCTGACGCCGTTCGTCTCCAGTCCACCTCCGGTAAGCCGCTCCCCCTCCCCCACCCAGAATCCGTGCCGTGGTCCTGATGCTCGACGACGCGGTGACGCCGACCATCCAGTCCACTGTCGCTGCTCTTCCAGCCACCGCCGCTCCTCTCCAGTTCACCGACACTGCG...

XM_057918303.1
CAATCTTAAATCTAATGTCATTCAACGTATCCTAATTCCTAAAGCTATTGAGATTTCTGCCTGGCGCCGCTCATCTCGTCCAGTCCACCACCGCTGACGCCGTTCGTCTCCAGTCCACCTCCGGTAAGCCGCTCCCCCTCCCCCACCCAGAATCCGTGCCGTGGTCCTGATGCTCGACGACGCGGTGACGCCGACCATCCAGTCCACTGTCGCTGCTCTTCCAGCCACCGCCGCTCCTCTCCAGTTCACCGACACTGCGC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130993424
ATGGATGCCCCCCCTGGCGATTGCCCTCGTGGACCTCCAATATTTGATGGTGACAGACCCTTTGGTGATCAGGATAGATACCGTGGTGGACCAAGAGGACCACCTGGTGAATTTGGTGGGGAAAAAGGTGGAGCTCCGGCTGACTTCCAACCTTCATTCAGGGAATCGCACAATAGCGCTCAACGCCCAAAACCCCTGCCAACAGAAATGGAGGGTTTAAATAGAGAGACAGAGAAGCCATGGCGCGTACTCGAATTCTA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057774286.1
MDAPPGDCPRGPPIFDGDRPFGDQDRYRGGPRGPPGEFGGEKGGAPADFQPSFRESHNSAQRPKPLPTEMEGLNRETEKPWRVLEFYSGIGGLRYSLMEAGVDAVVIEAFDINDVANDVYEHNFGHRPYQGNIQTLSAVNLDRYGADAWLLSPPCQPYTRQGLQKGSNDARASSFLKILELIPQCSRPPVMLFVENVVGFETSDTHEKMITMLRENHFDTQEFILSPLQFGVPYSRPRYFCLAKRKPIYFQKAQFNNALL...

XP_057774287.1
MDAPPGDCPRGPPIFDGDRPFGDQDRYRGGPRGPPGEFGGEKGGAPADFQPSFRESHNSAQRPKPLPTEMEGLNRETEKPWRVLEFYSGIGGLRYSLMEAGVDAVVIEAFDINDVANDVYEHNFGHRPYQGNIQTLSAVNLDRYGADAWLLSPPCQPYTRQGLQKGSNDARASSFLKILELIPQCSRPPVMLFVENVVGFETSDTHEKMITMLRENHFDTQEFILSPLQFGVPYSRPRYFCLAKRKPIYFQKAQFNNALL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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