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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002354`

染色体: Chr07 坐标: 21850499-21852893 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002354`
名称	SmilChr07G002354
描述	uncharacterized SmilChr07G002354
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21850499 - 21852893 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993960`
GeneID	`130993960`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993960`
原始查询	`SmilChr07G002354`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=26.2; qcov=0.813; evalue=2.02e-61; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=34.7; qcov=0.798; evalue=1.07e-100; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993960

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774982.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774982.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774982.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774982.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774982.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21850540`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A15,A16,A2,A5,B10,B114,B12,B126,B14,B28,B31,B33,B48,B52,B64,B70,B81,B82,B88,B89,B93,B94,B97,C13,C15,C28,C4,C40,C42,C43,C47,C5,C67,C74,C84,D8
`Chr7:21850578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B77,B93
`Chr7:21850618`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B4
`Chr7:21850618`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B4
`Chr7:21850622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr7:21850682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr7:21850712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B82
`Chr7:21850724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B38
`Chr7:21850733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A24,B94,C80
`Chr7:21850738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B72,C54,C59
`Chr7:21850752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr7:21850831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774982.1

723 aa

362

723

DBD_Tnp_Mut

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF03108 DBD_Tnp_Mut 12-67 aa PF10551 MULE 210-306 aa PF00872 Transposase_mut 228-309 aa PF04434 SWIM 458-488 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774982.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	12	67	6.1e-10	39.3	MuDR family transposase
`XP_057774982.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	210	306	6.5e-18	65.6	MULE transposase domain
`XP_057774982.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	228	309	3.8e-05	23.5	Transposase, Mutator family
`XP_057774982.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	458	488	6.3e-07	29.5	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918999.1
ATGGAGAATGTTGAAGATGAGATTGAAGGAAGCTTCAAGCTTGGGCAGACATTTAGCTCTGCTAAGGAAGCAAGAGAGGCAGTTCATCTATATGGAATACAGAATGGATACAAGCTGAGATTTGTGAAGAATGAGAAGACAAGGTTGAGGGTTGTTTGTGTCAATACAAAGAGTTGTCCGTTTCTATTCTATTGTTCCAAGATTGGGAATGATGGAGGTGTGGCTGTGAAGACTCTGATCTTAGAGCACAATTGTTACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993960
ATGGAGAATGTTGAAGATGAGATTGAAGGAAGCTTCAAGCTTGGGCAGACATTTAGCTCTGCTAAGGAAGCAAGAGAGGCAGTTCATCTATATGGAATACAGAATGGATACAAGCTGAGATTTGTGAAGAATGAGAAGACAAGGTTGAGGGTTGTTTGTGTCAATACAAAGAGTTGTCCGTTTCTATTCTATTGTTCCAAGATTGGGAATGATGGAGGTGTGGCTGTGAAGACTCTGATCTTAGAGCACAATTGTTACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774982.1
MENVEDEIEGSFKLGQTFSSAKEAREAVHLYGIQNGYKLRFVKNEKTRLRVVCVNTKSCPFLFYCSKIGNDGGVAVKTLILEHNCYKQREVPSLTQAFLANHFKNRVYKDPKYTAKQIQEDVKIQFKLHVSLFKCKRARKTILTELNGNIINEFKTLEAYIQILKDTNPGSNVELQLSKEGEEKGLRVFRRLFVMLDACKRNWLGGCRPIICLDGCHLKSMAGGVLLTAVGKDANDGIMPLAWAVVSKENKVNWTWFMKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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