当前解析结果
SmilChr07G002385| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002385 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002385 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002385 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 22261161 - 22262455 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993965 |
|---|---|
| GeneID | 130993965 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993965 |
| 原始查询 | SmilChr07G002385 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993965 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057774987.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057774987.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057774987.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774987.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774987.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:22261420 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B26,B59,B78,C51 |
Chr7:22261454 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A2 |
Chr7:22261890 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B123,B129 |
Chr7:22262017 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B39,B62,B96 |
Chr7:22262026 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,B45,C3,C47 |
Chr7:22262034 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C18,C64,C9 |
Chr7:22262042 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A14,B11,B45,C3,C47 |
Chr7:22262050 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B66,C18,C20,C41,D2 |
Chr7:22262052 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B131,C21,C79 |
Chr7:22262063 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C48,C76 |
Chr7:22262084 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B132,B62 |
Chr7:22262085 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A4,C48,C76 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。