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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002390`

染色体: Chr07 坐标: 22284890-22286408 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002390`
名称	SmilChr07G002390
描述	mitochondrial dicarboxylate/tricarboxylate transporter DTC-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22284890 - 22286408 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993474`
GeneID	`130993474`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993474`
原始查询	`SmilChr07G002390`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial dicarboxylate/tricarboxylate transporter DTC-like
产物	mitochondrial dicarboxylate/tricarboxylate transporter DTC-like
Arabidopsis	`AT5G19760` (AT5G19760) Mitochondrial substrate carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832096] identity=32; qcov=0.733; evalue=3.86e-23; confidence=low
Rice	`Os11g0432400` - identity=30.5; qcov=0.733; evalue=3.07e-19; confidence=low
GO	GO:0015367 (oxoglutarate:malate antiporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF00153 (Mito_carr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993474

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057774353.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.80000	`XP_057774353.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057774353.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774353.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774353.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22285322`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A2,B108,B119,B122,B132,B136,B139,B33,B47,B56,B65,B81,B91,B96,C14,C72,C82
`Chr7:22285450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:22285672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C83
`Chr7:22285724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:22286010`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	49	A11,A15,A20,A21,A24,B115,B120,B124,B136,B20,B39,B50,B52,B57,B6,B60,B63,B67,B70,B77,B83,B98,C11,C13,C14,C15,C18,C2,C28,C3,C34,C35,C40,C42,C49,C52,C54,C55,C56,C59,C64,C66,C67,C69,C7,C76,C81,D1,D10
`Chr7:22286014`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	49	A11,A15,A20,A21,A24,B115,B120,B124,B136,B20,B39,B50,B52,B57,B6,B60,B63,B67,B70,B77,B83,B98,C11,C13,C14,C15,C18,C2,C28,C3,C34,C35,C40,C42,C49,C52,C54,C55,C56,C59,C64,C66,C67,C69,C7,C76,C81,D1,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774353.1

273 aa

136

273

Mito_carr

PF00153 Mito_carr 94-181 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774353.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	94	181	1.6e-08	34.9	Mitochondrial carrier protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918370.1
CATTTCCTAAAACAAGCAGCTTCAAAGCTTTACACTTGCCACCCCAAAAACTACATGATTTTACTCCAAAACACCCACATTATACATCACACACTTCCAAAAGATAGAGAGAGAGTGAAGGCATGGGAAGCAGTAGCAGGAACTCCCATGGAGACGTAGTGAATCCATTGCTGAAAGGATTCCTCACAGGGCAGTTTCATGGTTTGTTCCATCACTACAATCGGTTGATGCTGGATGACCTTGCTCGATTGCGCAACCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993474
ATGGGAAGCAGTAGCAGGAACTCCCATGGAGACGTAGTGAATCCATTGCTGAAAGGATTCCTCACAGGGCAGTTTCATGGTTTGTTCCATCACTACAATCGGTTGATGCTGGATGACCTTGCTCGATTGCGCAACCCAGGTTCAAAAATGAAGTTCAACAATACAAATAAACAGAATTTGAAATTAAATATACTTAATGGATGTATCCGCCCAACGGCATCACTCGGAATATTTGAGATTTTGAGGAAGAGGCTTAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774353.1
MGSSSRNSHGDVVNPLLKGFLTGQFHGLFHHYNRLMLDDLARLRNPGSKMKFNNTNKQNLKLNILNGCIRPTASLGIFEILRKRLRNSNEGRPLSVYQEGCCGFMAACATVFAWKPFDLAYRRVGIQSLSYTNWFSSLTHIAKNQSVLSMYKSSRGSMNSDIALYTGMLASYDRTLHYLTHTQALPYWAAQTSASIISGFFAAACSHPVIYMDAIIDTRLQMRYIPATICAILNPFGNFNFYTRLLSRFQYSARFCVVQY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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