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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002394`

染色体: Chr07 坐标: 22316153-22321037 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002394`
名称	SmilChr07G002394
描述	pectin acetylesterase 9
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22316153 - 22321037 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993478`
GeneID	`130993478`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993478`
原始查询	`SmilChr07G002394`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectin acetylesterase 9
产物	pectin acetylesterase 9
Arabidopsis	`AT5G23870` (AT5G23870) Pectinacetylesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832452] identity=70.5; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0634600` (P0455H11.118-1) - identity=56.2; qcov=0.919; evalue=1.85e-151; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03283 (PAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993478

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057774361.1`
2	Lysosome	溶酶体	0.40000	`XP_057774361.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057774361.1`
4	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057774361.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774361.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22316936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C37
`Chr7:22316998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B42,B43,C41,C74
`Chr7:22318383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr7:22319592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr7:22319721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B42,B43,C50
`Chr7:22319721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,C50
`Chr7:22319734`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	29	A13,A18,A19,A24,A8,B1,B101,B124,B25,B37,B38,B42,B43,B55,B6,B71,B74,B95,B97,C14,C31,C32,C50,C62,C68,C72,C82,D10,D11
`Chr7:22319777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C1
`Chr7:22319911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774361.1

395 aa

198

395

PAE

PF03283 PAE 26-391 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774361.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	26	391	5.6e-164	546.3	Pectinacetylesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918378.1
AAATAAATATGGACACAATCTTTCCTCCTTCACTATTCTCTTTCATTCATGTAAGTATCGCTCCATCGCACAATAATAATGCCCTCTAAAAAATATCTTGTGTCCAATCCCGCATGCTAGTCGTTTTCCTTATATAATTCCTTCTTATCTCCCCGATTACTCCATCTCGTGGAAATCAAATTTCTATGGTTTGATGTCTTAATTACTAAATATTACTGTCAGCTTTGTGTTTTATTCAACCAATATATGTCATAACTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993478
ATGAAGGCGAATGCGGCGATAGCCGCGTTTAGGTTTCTGCTACTAACGTGCGCGGCGCGGTGCATTAGCTCGCAGGGGCAGCGGCGCGTGAACATGACTCTCGTCCGGAACGCTTCGTCGATGGGCGCATATTGCTTGGACGGAAGTTTGCCGGCGTATCATTTGGACAGAGGATTTGGGGCGGGGGCGCGCAACTGGCTTTTGCAATTTGAGGGTGGTGGGTGGTGCAACGACGTCAAATCCTGCCTCGACAGAGCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774361.1
MKANAAIAAFRFLLLTCAARCISSQGQRRVNMTLVRNASSMGAYCLDGSLPAYHLDRGFGAGARNWLLQFEGGGWCNDVKSCLDRASTRRGSTLHMSKVEIFSGILSNNASLNPDFYNWNRVKLRYCDGASFAGDAVFDNGTSLLYFRGQRIWQAIILDLLPKGLGQAKKALLSGCSAGGLATFLHCDNFSSYLPQNASVKCLSDAGFFLDARDIAMNHSMRYFYKSVVSLQGVEKNLNKNCTTSGFPELCFFPQYVLPY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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