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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002399`

染色体: Chr07 坐标: 22337319-22339852 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002399`
名称	SmilChr07G002399
描述	tubulin beta-1 chain
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22337319 - 22339852 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993480`
GeneID	`130993480`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993480`
原始查询	`SmilChr07G002399`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tubulin beta-1 chain
产物	tubulin beta-1 chain
Arabidopsis	`AT5G23860` (TUB8) tubulin beta 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832451] identity=98; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0105600` (OsTUB2) - identity=96.6; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000226 (microtubule cytoskeleton organization); GO:0000278 (mitotic cell cycle); GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005200 (structural constituent of cytoskeleton); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005874 (microtubule)
KEGG	smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04517 (IgSF CAM signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04814 (Motor proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00091 (Tubulin); PF03953 (Tubulin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993480

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057774363.1`
2	Spindle	Spindle	0.40000	`XP_057774363.1`
3	Spindle pole	Spindle pole	0.40000	`XP_057774363.1`
4	Centrosome	中心体	0.20000	`XP_057774363.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774363.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22337831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr7:22337963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr7:22338064`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	174	A1,A10,A15,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A6,A7,A8,A9,B1,B101,B102,B103,B104,B106,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B118,B120,B121,B125,B126,B127,B129,B13,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B17,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B31,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B48,B49,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B59,B60,B61,B62,B64,B65,B66,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B8,B80,B81,B82,B84,B85,B86,B88,B89,B9,B94,B95,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C27,C28,C3,C30,C31,C33,C34,C36,C37,C38,C39,C4,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C53,C55,C57,C58,C59,C60,C61,C63,C66,C68,C69,C70,C71,C74,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C86,C87,C9,D10,D4,D7,D9
`Chr7:22338068`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	163	A1,A10,A15,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A6,A7,A8,B1,B101,B102,B103,B104,B106,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B117,B118,B12,B120,B121,B125,B126,B127,B129,B13,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B17,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B31,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B48,B49,B5,B51,B53,B54,B55,B59,B60,B61,B62,B65,B66,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B8,B80,B81,B82,B84,B85,B86,B88,B89,B9,B94,B95,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C17,C18,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C27,C3,C30,C33,C34,C36,C37,C38,C39,C4,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C53,C57,C58,C59,C60,C61,C63,C66,C68,C69,C70,C71,C74,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C86,C87,C9,D10,D4,D7,D9
`Chr7:22338674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr7:22338807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B101,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774363.1

449 aa

224

449

Tubulin

Tubulin_C

PF00091 Tubulin 3-211 aa PF03953 Tubulin_C 261-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774363.1`	Pfam	`PF00091`	Tubulin	Domain	3	211	1.5e-64	218.5	Tubulin/FtsZ family, GTPase domain
`XP_057774363.1`	Pfam	`PF03953`	Tubulin_C	Domain	261	382	1.2e-40	139.3	Tubulin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918380.1
AAAACTGCCCGTTATTTGAACCCCATTCACTCATCAGTCTCTGCACTCCGCACTCACAAACTCACTCTCTCCTTCTCTCTCTGTGCAAACACACTCTCTTCTCTTTCACTTGTGCAAAATGCGTGAGATCTTGCACATCCAGGGTGGCCAGTGCGGTAACCAAATCGGTGCAAAATTTTGGGAGGTAGTGTGCGCTGAGCACGGGATCGACTCCACCGGACGCTACAGTGGCGACAACGATCTCCAATTGGAGCGCGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993480
ATGCGTGAGATCTTGCACATCCAGGGTGGCCAGTGCGGTAACCAAATCGGTGCAAAATTTTGGGAGGTAGTGTGCGCTGAGCACGGGATCGACTCCACCGGACGCTACAGTGGCGACAACGATCTCCAATTGGAGCGCGTGAACGTCTACTATAATGAAGCCAGCTGCGGGAGGTTTGTTCCGCGTGCCGTGCTCATGGATTTGGAGCCCGGCACCATGGACAGCGTTAGATCTGGGACGTACGGGCAGATTTTCAGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774363.1
MREILHIQGGQCGNQIGAKFWEVVCAEHGIDSTGRYSGDNDLQLERVNVYYNEASCGRFVPRAVLMDLEPGTMDSVRSGTYGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELIDSVLDVVRKEAENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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