当前解析结果
SmilChr07G002400| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002400 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002400 |
| 描述 | actin-depolymerizing factor 7-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 22352225 - 22353625 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130993483 |
|---|---|
| GeneID | 130993483 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993483 |
| 原始查询 | SmilChr07G002400 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | actin-depolymerizing factor 7-like |
| 产物 | actin-depolymerizing factor 7-like |
| Arabidopsis | AT4G25590 (ADF7)actin depolymerizing factor 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828664] identity=77.2; qcov=0.993; evalue=1.31e-78; confidence=high |
| Rice | Os04g0555700 (OsADF6)- identity=77.5; qcov=1.01; evalue=5.34e-78; confidence=high |
| GO | GO:0005737 (cytoplasm); GO:0015629 (actin cytoskeleton); GO:0030042 (actin filament depolymerization); GO:0051015 (actin filament binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00241 (Cofilin_ADF) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993483 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 1.00000 | XP_057774367.1 |
| 2 | Cell projection | 细胞突起 | 0.80000 | XP_057774367.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057774367.1 |
| 4 | Pseudopodium | Pseudopodium | 0.40000 | XP_057774367.1 |
| 5 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057774367.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:22352988 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057774367.1PF00241
Cofilin_ADF 7-136 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057774367.1 |
Pfam | PF00241 |
Cofilin_ADF | Domain | 7 | 136 | 1.4e-41 | 142.0 | Cofilin/tropomyosin-type actin-binding protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。