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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002405`

染色体: Chr07 坐标: 22408688-22409723 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002405`
名称	SmilChr07G002405
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 39
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22408688 - 22409723 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993486`
GeneID	`130993486`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993486`
原始查询	`SmilChr07G002405`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 39
产物	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 39
Arabidopsis	`AT5G23760` (AT5G23760) Copper transport protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832441] identity=66.7; qcov=0.911; evalue=6.36e-15; confidence=low
Rice	`Os10g0506100` - identity=56.5; qcov=0.873; evalue=1.72e-20; confidence=low
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00403 (HMA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993486

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057774372.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057774372.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774372.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774372.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774372.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22409065`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A7,B30,B35,B99,D6
`Chr7:22409065`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A7,B30,B35,B99,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774372.1

86 aa

HMA

PF00403 HMA 6-62 aa

XP_057774373.1

85 aa

HMA

PF00403 HMA 5-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774372.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	6	62	8e-06	26.9	Heavy-metal-associated domain
`XP_057774373.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	5	61	7.9e-06	26.9	Heavy-metal-associated domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918392.1
ACCACAACTTAATTCTTATCTCGTCCAAATATGCAATTATGCATGTCGTAAATTGGAAAAAGAAGGTCAACTCATGTAAATTTCTCAACCGCCATTTGTTTGACCCAAACAAAATGTCTGGATTCATTTATATATCTCACCTTTTTATTTATTCGCCGCCATAACGATAGCTTATTGATCAATTTTTATTTTATATGATGAGAATGAGAATACGTCTGCTTTATTTAACCTGCAGTGTTGGTGCGATTATTATTCATGTT...

XM_057918390.1
ACTTAATTCTTATCTCGTCCAAATATGCAATTATGCATGTCGTAAATTGGAAAAAGAAGGTCAACTCATGTAAATTTCTCAACCGCCATTTGTTTGACCCAAACAAAATGTCTGGATTCATTTATATATCTCACCTTTTTATTTATTCGCCGCCATAACGATAGCTTATTGATCAATTTTTATTTTATATGATGAGAATGAGAATACGTCTGCTTTATTTAACCTGCAGTGTTGGTGCGATTATTATTCATGTTACCCAT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130993486
ATGGCTCAGAAGTTGGTGGTGAGGGTGTTAACCATGACCGACGAAAAGACGAAGCAGAAAGCCATGGAAGCAGCGGCCGATATTTTGGGTGTGGATTCGATCGCAGCAGATGTGAAGGATCAGAAGGTGACGGTGGTGGGCCAAATGGACGTAGTTGCTGTTGTCAACAGACTCAAGAAAGTTGGTAAGCTCGAGATAATGTCGGTGGGCCCAGCAAAGGAACCCCTAAATACTACTCCTATTCAAGAGGATAAGAAATA...

LOC130993486
ATGGCTCAGAAGTTGGTGGTGAGGGTGTTAACCATGACCGACGAAAAGACGAAGCAGAAAGCCATGGAAGCAGCGGCCGATATTTTGGCAGATGTGAAGGATCAGAAGGTGACGGTGGTGGGCCAAATGGACGTAGTTGCTGTTGTCAACAGACTCAAGAAAGTTGGTAAGCTCGAGATAATGTCGGTGGGCCCAGCAAAGGAACCCCTAAATACTACTCCTATTCAAGAGGATAAGAAATAA

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057774372.1
MAQKLVVRVLTMTDEKTKQKAMEAAADILGVDSIAADVKDQKVTVVGQMDVVAVVNRLKKVGKLEIMSVGPAKEPLNTTPIQEDKK

XP_057774373.1
MAQLVVRVLTMTDEKTKQKAMEAAADILGVDSIAADVKDQKVTVVGQMDVVAVVNRLKKVGKLEIMSVGPAKEPLNTTPIQEDKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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