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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002414`

染色体: Chr07 坐标: 22504885-22507418 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002414`
名称	SmilChr07G002414
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g48880
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22504885 - 22507418 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993495`
GeneID	`130993495`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993495`
原始查询	`SmilChr07G002414`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g48880
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g48880
Arabidopsis	`AT3G48880` (AT3G48880) RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824049] identity=61.5; qcov=1.01; evalue=3.75e-145; confidence=high
Rice	`Os10g0502900` (OsFbox557) - identity=56.9; qcov=0.993; evalue=1.96e-124; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993495

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057774383.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057774383.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057774383.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774383.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774383.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22506040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:22506108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B89
`Chr7:22506174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B89
`Chr7:22506195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C5
`Chr7:22506252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B44,C71,D7
`Chr7:22506285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr7:22506731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,D7
`Chr7:22506733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B46,C8
`Chr7:22506754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr7:22506756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B115,B124,B20
`Chr7:22506762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr7:22506774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774383.1

306 aa

153

306

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 12-54 aa PF12937 F-box-like 18-58 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774383.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	12	54	2.9e-05	24.5	F-box domain
`XP_057774383.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	18	58	1.3e-09	38.4	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918400.1
TCCTTTTTTATCTCCTCGAATCTGATTCTCTCTCCTAATCTCACTTGCACAGTTAGTTACACTACATGATGACTGCCTAAAATTTCATTTCAATAAACAGAAAAACAATTACATATGCAATAAATAGCCAATTTCAGATTGGCTCATATCAAGAATAAACCCGTATACACGAAGATCCCTAAAATTCAAGGCTGGTTTGAGGATTTTGTGAAGTGTGAATGATGGAGGAGATGTATTCTGGTCTGAGACGATGGGAGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993495
ATGATGGAGGAGATGTATTCTGGTCTGAGACGATGGGAGGACATGGATATTGATATCTTGGTGAAGATTTTCGAGAATTTGAACATCGTTGAACTCACCTCTGGAGTTGCTCATGTTTGTCACACGTGGAGAATGGCGGCCTGTGACCCTTTGCTATGGAGGACACTTGATTTGTCTTTGCTAAAGTCCAACTTCATCAAAATCCCGTTGGAGCCCTACGTGTATGTGGATGGCCGATCTGATAAAACTTTTACGCGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774383.1
MMEEMYSGLRRWEDMDIDILVKIFENLNIVELTSGVAHVCHTWRMAACDPLLWRTLDLSLLKSNFIKIPLEPYVYVDGRSDKTFTRVLKIALNLSRQNILTLIFHYNMYVSDDQLTYTAQRCPRLKRLVMPAWNRIKKTGICRAVRMWEDLESLTMPSISNPPYLMEEISRSCKNFAELKVMGPCDIFFASTLAAFLPNLKVLSLRCSVLFKDALIIILECLPGLEVLNISHCLLVEVPPQPAPRRVLGALDKSILERAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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