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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002417`

染色体: Chr07 坐标: 22520053-22521551 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002417`
名称	SmilChr07G002417
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 21
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22520053 - 22521551 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993500`
GeneID	`130993500`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993500`
原始查询	`SmilChr07G002417`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 21
产物	fasciclin-like arabinogalactan protein 21
Arabidopsis	`AT5G06920` (FLA21) FASCICLIN-like arabinogalactan protein 21 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830583] identity=41.1; qcov=0.847; evalue=4.71e-61; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02469 (Fasciclin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993500

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057774386.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057774386.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057774386.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057774386.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774386.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22520142`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A10,A7,B117,B30,B37,B59,B65,B75,B84,C16,C50,C57,C86,D11
`Chr7:22520299`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	145	A1,A11,A13,A15,A16,A18,A19,A20,A22,A23,A25,A4,A5,A6,A8,B1,B10,B100,B102,B106,B107,B109,B11,B110,B112,B113,B119,B12,B120,B123,B124,B126,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B14,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B23,B24,B26,B28,B29,B32,B33,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B59,B61,B62,B64,B68,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B8,B80,B84,B86,B87,B9,B90,B92,B93,B95,B97,B99,C10,C14,C16,C17,C21,C23,C24,C25,C27,C29,C30,C31,C32,C34,C38,C4,C43,C46,C47,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C57,C59,C62,C63,C64,C66,C68,C70,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C84,C85,C87,C9,D1,D2,D3,D5,D9
`Chr7:22520436`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B47
`Chr7:22520436`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B47
`Chr7:22520443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C5
`Chr7:22520451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B101
`Chr7:22520474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C5
`Chr7:22520574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr7:22520640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C72
`Chr7:22520774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr7:22520820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr7:22520867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B44,C71,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774386.1

405 aa

202

405

Fasciclin

PF02469 Fasciclin 305-396 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774386.1`	Pfam	`PF02469`	Fasciclin	Domain	305	396	5.8e-14	53.1	Fasciclin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918403.1
GAATACATGAGAAAACATCTAAAATTCATGAATTTGAGATAAAATTGGTAGTGTAGAGTTTGAGATAGCAAAAATTTACACAAATGATGGATATTAGCAATTTACTTATTCCAACACGTATAAATACAGTGGATGGTTACCTATCTTTCCCAAGCAAGATAACAATTAGTCATCACTTGGTGTGTACAAGAAAAACTTTTCTTGATTTTGTCATCTTTTCAGTAGACTGCGTCTCACTTCTTCTTCTATTTTGTGAGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993500
ATGATGGATATTAGCAATTTACTTATTCCAACACGTATAAATACAGTGGATGGTTACCTATCTTTCCCAAGCAAGATAACAATTAGTCATCACTTGGTGTGTACAAGAAAAACTTTTCTTGATTTTGTCATCTTTTCAGTAGACTGCGTCTCACTTCTTCTTCTATTTTGTGAGATTGAAATTATCACACACACACAATCAAAATTGGCAAGTGCAATGGCAGCAGATTCGTCGTGTTCCCACTGGTGGCACGCCCCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774386.1
MMDISNLLIPTRINTVDGYLSFPSKITISHHLVCTRKTFLDFVIFSVDCVSLLLLFCEIEIITHTQSKLASAMAADSSCSHWWHAPLYLGMSLTLALMAISSAKYPSPIHPLPPPIPHALAFNASTALRLRGAFHITATLLQISPELFLSSPETTLFAIQDSAISNLSLPPSTMRHLLRFHAVPAALPMAELSKKPTGFCFNTLAHDDDRLAITTNNDDGTLMINHVLVSHPDMFLQGPLAVHGVAAPFDTTPPSCRLFN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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