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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002427`

染色体: Chr07 坐标: 22594741-22599568 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002427`
名称	SmilChr07G002427
描述	40S ribosomal protein S4-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22594741 - 22599568 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993973`
GeneID	`130993973`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993973`
原始查询	`SmilChr07G002427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S4-like
产物	40S ribosomal protein S4-like
Arabidopsis	`AT5G58420` (AT5G58420) Ribosomal protein S4 (RPS4A) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835955] identity=73; qcov=0.854; evalue=1.38e-76; confidence=high
Rice	`Os01g0358400` - identity=72.2; qcov=0.848; evalue=1.99e-74; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00467 (KOW); PF00900 (Ribosomal_S4e); PF16121 (40S_S4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993973

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774995.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057774995.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774995.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774995.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774995.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22594754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B21,B85,C27,D10
`Chr7:22594761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B21,B85,C27,D10
`Chr7:22594763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B85,C27
`Chr7:22594783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B59,B75,B8
`Chr7:22594788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B21,B85,C27,D10
`Chr7:22594825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr7:22594831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B115
`Chr7:22594837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr7:22594847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:22594852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr7:22594862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C5
`Chr7:22594863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774995.1

178 aa

178

Ribosomal_S4e

KOW

40S_S4_C

PF00900 Ribosomal_S4e 50-85 aa PF00467 KOW 93-126 aa PF16121 40S_S4_C 128-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774995.1`	Pfam	`PF00900`	Ribosomal_S4e	Family	50	85	4.2e-11	43.2	Ribosomal family S4e
`XP_057774995.1`	Pfam	`PF00467`	KOW	Family	93	126	3.8e-07	30.4	KOW motif
`XP_057774995.1`	Pfam	`PF16121`	40S_S4_C	Family	128	173	9e-25	86.7	40S ribosomal protein S4 C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919012.1
ATGGACTACCAAGGATGGAGCGCCGCCGCCGCCGCTCACCTCCCCTTCATCCCTCTCTCGCATTTTCGGCAGCGGACGACCAAGGAGGAGCCGGCGCTGCAAATCTGCTCCGATTGCGCCTCGCATTTGTGTGAGAGTAGTGAGAGAAGTGGCATTCCTTACATCAACACTTTTGATGGAATGACCATTCGCTACCCAGACCCTCTTATCAAGGCTAATGACACTATCAAGCTAGATCTTGATAGCAACAAAATTGTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993973
ATGGACTACCAAGGATGGAGCGCCGCCGCCGCCGCTCACCTCCCCTTCATCCCTCTCTCGCATTTTCGGCAGCGGACGACCAAGGAGGAGCCGGCGCTGCAAATCTGCTCCGATTGCGCCTCGCATTTGTGTGAGAGTAGTGAGAGAAGTGGCATTCCTTACATCAACACTTTTGATGGAATGACCATTCGCTACCCAGACCCTCTTATCAAGGCTAATGACACTATCAAGCTAGATCTTGATAGCAACAAAATTGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774995.1
MDYQGWSAAAAAHLPFIPLSHFRQRTTKEEPALQICSDCASHLCESSERSGIPYINTFDGMTIRYPDPLIKANDTIKLDLDSNKIVDFIKYDVGNVVMVIGGRNRGRVGVIKNREKHKGSFETLHIEDASGHEFATRSGNVFTIGKGTKPWISLPKGKGIKLTIIEEARKRIQLSLLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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