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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002428`

染色体: Chr07 坐标: 22600967-22601666 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002428`
名称	SmilChr07G002428
描述	putative non-specific lipid-transfer protein 14
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22600967 - 22601666 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993508`
GeneID	`130993508`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993508`
原始查询	`SmilChr07G002428`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative non-specific lipid-transfer protein 14
产物	putative non-specific lipid-transfer protein 14
Arabidopsis	`AT5G62065` (AT5G62065) Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008322] identity=58.7; qcov=0.736; evalue=2.83e-37; confidence=medium
Rice	`Os11g0115350` (LTP2-A) - identity=35.4; qcov=0.768; evalue=9.85e-13; confidence=low
GO	GO:0006869 (lipid transport); GO:0008289 (lipid binding); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993508

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057774398.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057774398.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774398.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774398.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774398.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22601099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B59,B84,C29
`Chr7:22601140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B129,B19
`Chr7:22601175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C33,C45,C46
`Chr7:22601177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:22601198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr7:22601216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C72,D1
`Chr7:22601234`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B93
`Chr7:22601234`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B93
`Chr7:22601264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr7:22601268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr7:22601393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C35
`Chr7:22601496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B108,B119,B122,B132,B81,B82,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774398.1

125 aa

125

LTP_2

Tryp_alpha_amyl

PF14368 LTP_2 19-101 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 26-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774398.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	19	101	1.6e-05	25.6	Probable lipid transfer
`XP_057774398.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	26	112	2.1e-07	31.8	Protease inhibitor/seed storage/LTP family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918415.1
AAATGAAGCCCATATAGCAAGCTATAAGAAGCTAGCAATATGGCCCCGTTTCTATTTCAATCCAATCCAATCCAATAAAGAAAAGAAAAAGATGGTGATTATGCAATTGAGGGCGTTTGCAGTGGTGATAGTGTTATGGGCATTCCCGGCGGGTTCGTCGATGGAGTGCAGCACGGTGACGGCATTGGTGTCGTCGTGCTCGAGTTTCGTGACACACGGGTCACCGGATCCGATGCCGGGATCCCCCTGCTGCACGGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993508
ATGGTGATTATGCAATTGAGGGCGTTTGCAGTGGTGATAGTGTTATGGGCATTCCCGGCGGGTTCGTCGATGGAGTGCAGCACGGTGACGGCATTGGTGTCGTCGTGCTCGAGTTTCGTGACACACGGGTCACCGGATCCGATGCCGGGATCCCCCTGCTGCACGGCCATGACAACCCTCAACAACGTCGCTGACTCAGGCGACAACCGCCGCAGAGTCTGCCGCTGCTTGATGGACTTGATTACCTCTTACAACCCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774398.1
MVIMQLRAFAVVIVLWAFPAGSSMECSTVTALVSSCSSFVTHGSPDPMPGSPCCTAMTTLNNVADSGDNRRRVCRCLMDLITSYNPNATAIATLPGFCGVSLGFTIDPNTDCEYVDQFSELGGRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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