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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002429`

染色体: Chr07 坐标: 22606680-22609864 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002429`
名称	SmilChr07G002429
描述	protein IQ-DOMAIN 23
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22606680 - 22609864 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993511`
GeneID	`130993511`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993511`
原始查询	`SmilChr07G002429`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IQ-DOMAIN 23
产物	protein IQ-DOMAIN 23
Arabidopsis	`AT4G23060` (IQD22) IQ-domain 22 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828405] identity=38; qcov=1.14; evalue=1.15e-40; confidence=medium
Rice	`Os04g0569900` - identity=36.6; qcov=0.856; evalue=6.24e-46; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00612 (IQ); PF13178 (DUF4005)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993511

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057774400.1`
2	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057774400.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057774400.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057774400.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22607067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr7:22607116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B85,C27,C44
`Chr7:22607323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B51,C27,C44
`Chr7:22607443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:22607456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C57,C86
`Chr7:22607544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr7:22607763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C82
`Chr7:22607780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr7:22607986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C65
`Chr7:22608017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C18
`Chr7:22608073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr7:22609523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774400.1

450 aa

225

450

DUF4005

PF00612 IQ 113-131 aa PF00612 IQ 137-151 aa PF13178 DUF4005 333-400 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774400.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	113	131	3.4e-07	30.2	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057774400.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	137	151	3.4e-07	30.2	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057774400.1`	Pfam	`PF13178`	DUF4005	Family	333	400	2.4e-10	41.6	Protein of unknown function (DUF4005)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918417.1
GGTCACTCTCTCCCTCCCACTGTGAAAAAGTTTAAAATTAAAGCTCCCCCACTCCAATAAATACCAGAGACTGATCTTTTCGTCATAATCAGATGCTCTCTCCATCAAAATGCTCAATCCGCCTCAACTTCAATCCATCTCTTTAACTCTAATTGCTATAATGCGCCATGGGTAAGGCGGCCAAGTGGTTCCGTTCGCTTTTCAGCTCCAAAAAGCCGCCGGCATCTTCGCCGGCGAAAGACAACAAGAAGAATAAGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993511
ATGGGTAAGGCGGCCAAGTGGTTCCGTTCGCTTTTCAGCTCCAAAAAGCCGCCGGCATCTTCGCCGGCGAAAGACAACAAGAAGAATAAGTGGGCCCTCTCCGATTCCGTCGATGCTTCGCTCAAGTTCAAGAATTATGTCCAAGACCCCATGGCCAGTCCCTACATTGAGGGACTCGACGCCAACAAGCATGCAATAGCGGTCGCCGCCGCCACCGCGGCTGTCGCCGAGGCCGCGCTGGCTGCCGCCCAAGCCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774400.1
MGKAAKWFRSLFSSKKPPASSPAKDNKKNKWALSDSVDASLKFKNYVQDPMASPYIEGLDANKHAIAVAAATAAVAEAALAAAQAAAQVVRLTSGGGSGRTAPYLADRRSVLAAVKIQSAFRAYLAKRALRALKGLVKLQALVRGHIVRKQSADMLYRMQTMAKIQARASAHRSYTSESSDARINFFSNSNHTGMATLGKNTERSNTLKHGGSLLKQHHSRSHIGNNAIKEKSHIASRWLNHWMEQSAWNNLHEASLESG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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