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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002432`

染色体: Chr07 坐标: 22633205-22639375 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002432`
名称	SmilChr07G002432
描述	probable transcriptional regulator SLK2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22633205 - 22639375 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993512`
GeneID	`130993512`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993512`
原始查询	`SmilChr07G002432`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable transcriptional regulator SLK2
产物	probable transcriptional regulator SLK2
Arabidopsis	`AT5G62090` (SLK2) SEUSS-like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836329] identity=55.6; qcov=0.677; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0126000` (OsSEU3) - identity=42.7; qcov=0.942; evalue=1.33e-172; confidence=medium
GO	GO:0000122 (negative regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0005634 (nucleus); GO:0005667 (transcription regulator complex); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF01803 (LIM_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993512

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774401.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774401.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774401.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774401.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774401.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22633547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C78
`Chr7:22633583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B59,C29
`Chr7:22633630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr7:22633707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B124,B20,D10
`Chr7:22633976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:22634199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr7:22634696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B51,B85,C27,C44
`Chr7:22636065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr7:22636179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr7:22637661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:22637739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr7:22637964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,C16,C19,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774401.1

832 aa

416

832

LIM_bind

PF01803 LIM_bind 293-553 aa

XP_057774402.1

832 aa

416

832

LIM_bind

PF01803 LIM_bind 293-553 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774401.1`	Pfam	`PF01803`	LIM_bind	Family	293	553	3.3e-64	217.4	LIM-domain binding protein
`XP_057774402.1`	Pfam	`PF01803`	LIM_bind	Family	293	553	3.3e-64	217.4	LIM-domain binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918418.1
ACACTCCCTTTTGTTTCCCGCTAGGTAACTGAGCACCGATCACCAGCCGAGCTTGCGTGCCTTTCCCTTTTTCTTTTATGTAAAATTCTCTCTCTCCATATATTACTACTACTATTTTCTTCCATTCATGTTACTCATCTCTTATCGCAATTGCAAAACAAATCAATTTGAGATTCCTTGGTTGAGTGGGTCACTGCTGGGTATTGCAAACAACTGCCGGTGAAAAAACTGACATATATGACGGCCCAATTTGGGGATAT...

XM_057918419.1
CCGCTAGGTAACTGAGCACCGATCACCAGCCGAGCTTGCGTGCCTTTCCCTTTTTCTTTTATTTGCAAAACAAATCAATTTGAGATTCCTTGGTTGAGTGGGTCACTGCTGGGTATTGCAAACAACTGCCGGTGAAAAAACTGACATATATGACGGCCCAATTTGGGGATATCTGTTTAGCTGGATTGAACTGTTGTAATCATTGTGTTAGCCTCTAATTTCTAAGTACTGGAACTGATTACTACTTGGATCCCTGTTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993512
ATGGTGCCTTCAAGGGTGGCTGGAGGAACAGCACAATCTTCTTCAAGCTCGGGAATTTTCTTTCAAGAGGATGGACAAGGCCAGGTTCCGGGAAATTCCCAGTTCAGTTCAAATTTTAGGAACTCGTCAACTTCATTACCTGGACATGCACAGGCTCAAACAGGTCCCTTTTCTGGGGATGTCAGCAATACAGTCTTAAATAGTTTGGCAAGCTCTGGCCCCAGTGTTGGGGCAAGTTCTTTGGTTACTGATGCGAACTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774401.1
MVPSRVAGGTAQSSSSSGIFFQEDGQGQVPGNSQFSSNFRNSSTSLPGHAQAQTGPFSGDVSNTVLNSLASSGPSVGASSLVTDANSGLSGGPHLQRSASVNTESYMRLPASPMSFSSNNISISGSSVMDGSSVVQQSSNQDPGSQHTQQNQQHHGVSSATSLPRMGQVQFHGGARVHNSLAQDQTTMSQLQKKPRLDIKQEDVVQQQVLQQLLQRQDSMHLQNSNPQLQALIQQQRLRQQEQQILQAMPPLQRVQLLQQ...

XP_057774402.1
MVPSRVAGGTAQSSSSSGIFFQEDGQGQVPGNSQFSSNFRNSSTSLPGHAQAQTGPFSGDVSNTVLNSLASSGPSVGASSLVTDANSGLSGGPHLQRSASVNTESYMRLPASPMSFSSNNISISGSSVMDGSSVVQQSSNQDPGSQHTQQNQQHHGVSSATSLPRMGQVQFHGGARVHNSLAQDQTTMSQLQKKPRLDIKQEDVVQQQVLQQLLQRQDSMHLQNSNPQLQALIQQQRLRQQEQQILQAMPPLQRVQLLQQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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