当前解析结果
SmilChr07G002449| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002449 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002449 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002449 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 23030925 - 23031953 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993979 |
|---|---|
| GeneID | 130993979 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993979 |
| 原始查询 | SmilChr07G002449 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0587600- identity=63.6; qcov=0.096; evalue=4.31e-08; confidence=weak |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993979 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057775001.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057775001.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775001.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775001.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775001.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:23030928 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,B106,B35 |
Chr7:23030980 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,B101,B120,B95 |
Chr7:23030998 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A25,B61 |
Chr7:23031043 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B106,B35,C10 |
Chr7:23031135 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A11 |
Chr7:23031158 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B61,C46 |
Chr7:23031167 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C42 |
Chr7:23031167 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C42 |
Chr7:23031193 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C24 |
Chr7:23031203 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C24 |
Chr7:23031256 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C76 |
Chr7:23031309 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C28 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。