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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002464`

染色体: Chr07 坐标: 23170172-23171074 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002464`
名称	SmilChr07G002464
描述	uncharacterized SmilChr07G002464
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	23170172 - 23171074 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993982`
GeneID	`130993982`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993982`
原始查询	`SmilChr07G002464`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=28; qcov=0.523; evalue=7.73e-15; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993982

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775004.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775004.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057775004.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775004.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775004.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:23170178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B71,B89
`Chr7:23170220`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A1,A11,A16,A25,B102,B128,B136,B139,B15,B45,B67,B74,B91,C51,C53,C61,C72,C9
`Chr7:23170234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B93
`Chr7:23170240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A16,A18,A21,A23,B101,B128,B130,B15,B22,B27,B6,B63,B79,B83,C32,C35,C40,C56,C68,C77,C81,C84,D7
`Chr7:23170255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B93
`Chr7:23170273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C27
`Chr7:23170285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A1,A14,A2,A22,A8,B105,B110,B111,B117,B127,B139,B3,B32,B4,B41,B47,B56,B57,B58,B71,B72,B74,B88,B96,C14,C20,C24,C26,C30,C42,C50,C52,C59,C65,C67,C75,C78,C82,C9,D9
`Chr7:23170303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	48	A1,A14,A2,A22,A7,A8,A9,B105,B110,B111,B117,B127,B139,B3,B30,B32,B4,B41,B47,B56,B57,B58,B71,B72,B74,B84,B88,B9,B96,C14,C20,C24,C26,C30,C35,C42,C50,C52,C59,C65,C67,C71,C75,C78,C82,C83,C9,D9
`Chr7:23170338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B73,B91
`Chr7:23170353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B65,B73,B91,C64
`Chr7:23170372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B65,B91,C64
`Chr7:23170424`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B23,C16,C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775004.1

300 aa

150

300

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 103-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775004.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	103	149	2.4e-06	27.8	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919021.1
ATGGCCAAAGGGTTTTACACTCTTGTTTTCACATGTGCTGAGGATAAGGCGTTGGCGAAGCAACGAGCTGGATGGGAATTATCCAAAGGCTCTCTCCGAATCAGGGAATGGGTTCGATTCTTTGACCCTTACAAAGAAATCTCTTCTCTATGCCATGTTTGGGTCAGGTTATATTATCTTCCGATTGAGTTATGGCATCCGGAAGTGTTTGCTGCCATTGGTCGTACAATAGGTCTCCCGATACGTTTTGATAGCCCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993982
ATGGCCAAAGGGTTTTACACTCTTGTTTTCACATGTGCTGAGGATAAGGCGTTGGCGAAGCAACGAGCTGGATGGGAATTATCCAAAGGCTCTCTCCGAATCAGGGAATGGGTTCGATTCTTTGACCCTTACAAAGAAATCTCTTCTCTATGCCATGTTTGGGTCAGGTTATATTATCTTCCGATTGAGTTATGGCATCCGGAAGTGTTTGCTGCCATTGGTCGTACAATAGGTCTCCCGATACGTTTTGATAGCCCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775004.1
MAKGFYTLVFTCAEDKALAKQRAGWELSKGSLRIREWVRFFDPYKEISSLCHVWVRLYYLPIELWHPEVFAAIGRTIGLPIRFDSPSAYKEVGHFARILVEVDLAQPLQESMTLGCGTNSFYIEFYYEQLPLYYSLCKITGHNRDKCNKCKVTATDVVPKMNYTDANKANNIKGVGLAAPRLKGKNWQPIDHNFKETGRETLMVEQRKPFSAEENILKELEDLNQRRKGVEAVFANANAFGPLANAVFNEDEISLITQGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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