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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002479`

染色体: Chr07 坐标: 23389791-23391061 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002479`
名称	SmilChr07G002479
描述	protein EXORDIUM-like 3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	23389791 - 23391061 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993559`
GeneID	`130993559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993559`
原始查询	`SmilChr07G002479`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein EXORDIUM-like 3
产物	protein EXORDIUM-like 3
Arabidopsis	`AT5G51550` (EXL3) EXORDIUM like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835229] identity=78.1; qcov=0.915; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0133600` (134P10.10) - identity=63.5; qcov=0.94; evalue=2.99e-139; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04674 (Phi_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057774471.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057774471.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057774471.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774471.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774471.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:23389930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr7:23389991`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B73
`Chr7:23389991`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B73
`Chr7:23390003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C15,C21
`Chr7:23390182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C12
`Chr7:23390288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,A7,B94,C80
`Chr7:23390347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B9,C35,C61
`Chr7:23390778`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A11,C70
`Chr7:23390778`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A11,C70
`Chr7:23390797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr7:23390803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,B81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774471.1

364 aa

182

364

Phi_1

PF04674 Phi_1 81-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774471.1`	Pfam	`PF04674`	Phi_1	Family	81	358	6.8e-102	341.3	Phosphate-induced protein 1 conserved region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918488.1
TCCCCAGTTTCCATTTATTTATTATTTTTTGTTCGTACATGCAAAATATTTTCATCACTATATATCTCATCCCAACCAACCCTCCCAATTCATTCCCCACAACTCCCTCCGCCGCCGTAATCATGTCCCCCCCGCCGCCGCTATCACTCACCTTAGCCCCGCTCCTCCTCTCCCTCTTCTTCGCCGCGCCGGTCCTATGCTGGCGGCCCTGGCCCAACGCCACCGACTTGCTCTACGGCGGTTCCAAGAAATACGAAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993559
ATGCAAAATATTTTCATCACTATATATCTCATCCCAACCAACCCTCCCAATTCATTCCCCACAACTCCCTCCGCCGCCGTAATCATGTCCCCCCCGCCGCCGCTATCACTCACCTTAGCCCCGCTCCTCCTCTCCCTCTTCTTCGCCGCGCCGGTCCTATGCTGGCGGCCCTGGCCCAACGCCACCGACTTGCTCTACGGCGGTTCCAAGAAATACGAAGGCTCGTCGGAATTCGTCCACCTTAAATACCACATGGGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774471.1
MQNIFITIYLIPTNPPNSFPTTPSAAVIMSPPPPLSLTLAPLLLSLFFAAPVLCWRPWPNATDLLYGGSKKYEGSSEFVHLKYHMGPVLTANITVYPIWYGTWQSSQKRIIRDFIDSISAADSKPPSVSGWWKTVRLYTDQTNNNISRTVHVGEQKNDRFYSHGKSLTRLSVQSVIKSAVTASTRPLPVNPKSGVYLLLTSDDVYVQDFCNNVCGFHYFTFPSIVGYTLPYAWVGNSAKLCPGVCAYPFAVPDYIPGLKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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