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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr07G002502

染色体: Chr07 坐标: 23733378-23740577 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr07G002502
名称SmilChr07G002502
描述uncharacterized SmilChr07G002502
染色体 / SeqIDChr07 / NC_080393.1
坐标与链方向23733378 - 23740577 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130993580
GeneID130993580
locus_tag-
NCBI NameLOC130993580
原始查询SmilChr07G002502

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述cyclin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843399]; symbol=AT1G70620; hit=AT1G70620; species=arabidopsis; confidence=low
产物cyclin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843399]; symbol=AT1G70620; hit=AT1G70620; species=arabidopsis; confidence=low
ArabidopsisAT1G70620 (AT1G70620)
cyclin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843399]
identity=34.3; qcov=0.609; evalue=7.14e-53; confidence=low
RiceOs04g0661700
-
identity=30.8; qcov=0.955; evalue=1.58e-47; confidence=low
GO-
KEGG-
PfamPF15996 (PNISR)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130993580

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057774492.1
2 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057774492.1
3 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057774492.1
4 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057774492.1
5 Telomere 端粒 0.00000 XP_057774492.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr7:23733927 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B72
Chr7:23733939 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B66
Chr7:23734689 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C61
Chr7:23734935 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B70,C13,C3,C42,C56
Chr7:23735106 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B80
Chr7:23735323 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C61
Chr7:23736708 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 C48,D10
Chr7:23736738 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B104
Chr7:23736866 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C59
Chr7:23737132 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C15
Chr7:23737392 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 D10,D11
Chr7:23738236 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 C48,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774492.1
1000 aa
N
1
500
1000
PNISR
C
PF15996 PNISR 491-571 aa
XP_057774493.1
998 aa
N
1
499
998
PNISR
C
PF15996 PNISR 489-569 aa
XP_057774494.1
997 aa
N
1
498
997
PNISR
C
PF15996 PNISR 491-571 aa
XP_057774495.1
995 aa
N
1
498
995
PNISR
C
PF15996 PNISR 489-569 aa
XP_057774496.1
972 aa
N
1
486
972
PNISR
C
PF15996 PNISR 491-571 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057774492.1 Pfam PF15996 PNISR Family 491 571 2.3e-06 28.8 Arginine/serine-rich protein PNISR
XP_057774493.1 Pfam PF15996 PNISR Family 489 569 2.3e-06 28.8 Arginine/serine-rich protein PNISR
XP_057774494.1 Pfam PF15996 PNISR Family 491 571 2.2e-06 28.8 Arginine/serine-rich protein PNISR
XP_057774495.1 Pfam PF15996 PNISR Family 489 569 2.2e-06 28.8 Arginine/serine-rich protein PNISR
XP_057774496.1 Pfam PF15996 PNISR Family 491 571 2.2e-06 28.9 Arginine/serine-rich protein PNISR

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA
XM_057918512.1
AAAAAAGGGGTATTGCTAAGAAAATAATACTAATTCCTCCCTTTGTACAAAATTCCCCTCAAATGTCCAATTCCCAGAAAAGGGAAGAAACACAGTGCAAGAATCATCAATCCACTTAATAAGATAAAACCCTTAAACCCAAATCGTCAAAAATTTCGACATGGAGTACCAGCAGCCCCACGGCTACATGAGGCATCCGCCACCGCCCCCGCCTCCGTCCGCGGCGGATCCCTTTCAAAGACCACCACTCCCTCCGCCCC...
XM_057918510.1
AAAAAAGGGGTATTGCTAAGAAAATAATACTAATTCCTCCCTTTGTACAAAATTCCCCTCAAATGTCCAATTCCCAGAAAAGGGAAGAAACACAGTGCAAGAATCATCAATCCACTTAATAAGATAAAACCCTTAAACCCAAATCGTCAAAAATTTCGACATGGAGTACCAGCAGCCCCACGGCTACATGAGGCATCCGCCACCGCCCCCGCCTCCGTCCGCGGCGGATCCCTTTCAAAGACCACCACTCCCTCCGCCCC...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA
LOC130993580
ATGGAGTACCAGCAGCCCCACGGCTACATGAGGCATCCGCCACCGCCCCCGCCTCCGTCCGCGGCGGATCCCTTTCAAAGACCACCACTCCCTCCGCCCCCGTCCAATCATCCGTGGCCCTACTCCGCTACGCAATTTCACTACCAACACCAAACTCAACACTCCCCTTCCCCCCCTCCGCCGCAGTGGCCGCCCCACTCGTCTGACCATGCTCAGTACCCTCAGCTTCCTCCCCCGCCTTATCAGGCGCATCAGCCTCC...
LOC130993580
ATGGAGTACCAGCAGCCCCACGGCTACATGAGGCATCCGCCACCGCCCCCGCCTCCGTCCGCGGCGGATCCCTTTCAAAGACCACCACTCCCTCCGCCCCCGTCCAATCATCCGTGGCCCTACTCCGCTACGCAATTTCACTACCAACACCAAACTCAACACTCCCCTTCCCCCCCTCCGCCGCAGTGGCCGCCCCACTCGTCTGACCATGCTCAGTACCCTCAGCTTCCTCCCCCGCCTTATCAGGCGCATCAGCCTCC...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA
XP_057774492.1
MEYQQPHGYMRHPPPPPPPSAADPFQRPPLPPPPSNHPWPYSATQFHYQHQTQHSPSPPPPQWPPHSSDHAQYPQLPPPPYQAHQPPHYHAHPHYPPPPPLPPRPPHGPQAYPQEWGSGSWSHHQSWQYPTAANNNEEDWAARAKAWAAAKSASDNQHTPSHFVPAGRIEDQNHFHEQYPQSMDPQFLDGHAPVAPASNYHQFPAAMGSSNRTGVGQLQDSQYMSSGQSSYGADVHAPFAARDGGIAGDSIPPFPPQEKS...
XP_057774493.1
MEYQQPHGYMRHPPPPPPPSAADPFQRPPLPPPPSNHPWPYSATQFHYQHQTQHSPSPPPPQWPPHSSDHAQYPQLPPPPYQAHQPPHYHAHPHYPPPPPLPPRPPHGPQAYPQEWGSGSWSHHQSWQYPTNNNEEDWAARAKAWAAAKSASDNQHTPSHFVPAGRIEDQNHFHEQYPQSMDPQFLDGHAPVAPASNYHQFPAAMGSSNRTGVGQLQDSQYMSSGQSSYGADVHAPFAARDGGIAGDSIPPFPPQEKSSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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