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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002510`

染色体: Chr07 坐标: 23801937-23805826 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002510`
名称	SmilChr07G002510
描述	uncharacterized SmilChr07G002510
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	23801937 - 23805826 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993588`
GeneID	`130993588`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993588`
原始查询	`SmilChr07G002510`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0640800; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0640800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G60230` (AT1G60230) Radical SAM superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842318] identity=76.1; qcov=0.802; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0640800` - identity=78.8; qcov=0.8; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008173 (RNA methyltransferase activity); GO:0030488 (tRNA methylation); GO:0051536 (iron-sulfur cluster binding); GO:0070475 (rRNA base methylation)
KEGG	-
Pfam	PF04055 (Radical_SAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993588

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057774507.1`
2	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057774507.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057774507.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774507.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774507.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:23802344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D3
`Chr7:23802416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr7:23802422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:23803219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:23804499`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C38
`Chr7:23804499`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C38
`Chr7:23804881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B33,C53
`Chr7:23805354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774507.1

454 aa

227

454

Radical_SAM

PF04055 Radical_SAM 195-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774507.1`	Pfam	`PF04055`	Radical_SAM	Domain	195	364	3.7e-16	60.5	Radical SAM superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918524.1
TGTGATGATGATAATGCTAATTGAGTAGCCATACTTTGCATTTAATCTGTAACTGTTAAAGTGGTGGATTTTGGAACTTGACGAGCAGGCCAATGGAGATGACGCTGAGCCGTGGGCAGTGGATGAGGCGGCACCTCGCAACCCTCTGTTTCCCCCTTCAACCTCTTCACTCTTCCTCTTTCTCACCAATTCGCTTTCTCAATCCCCCATCCATCTCTCACTCTCTCTACTCCTTTCCATTTCTCTCTAATGGCCCTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993588
ATGGAGATGACGCTGAGCCGTGGGCAGTGGATGAGGCGGCACCTCGCAACCCTCTGTTTCCCCCTTCAACCTCTTCACTCTTCCTCTTTCTCACCAATTCGCTTTCTCAATCCCCCATCCATCTCTCACTCTCTCTACTCCTTTCCATTTCTCTCTAATGGCCCTTCTCTCTCTTTCTCAGCCGCTGCCACTCTTCAATCCACTATCTCCTCCAACCCTAAAGGGGGCGACGAAAGTATTGAGATTCCAATGAAGGGTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774507.1
MEMTLSRGQWMRRHLATLCFPLQPLHSSSFSPIRFLNPPSISHSLYSFPFLSNGPSLSFSAAATLQSTISSNPKGGDESIEIPMKGSMVILKEMRYHELQKWVQSHGYRPAQAMMLWKRLYGNNIWAHCHEELEGLNKDFKKMLSEHAEFKALHLKDIVTASDGTKKILFTLEDGLVIETVVIPCRRGRTTVCVSSQVGCAMNCQFCYTGRMGLKRNLSAAEIVEQAVFARRLLSHEVGNITNVVFMGMGEPLHNIENVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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