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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002513`

染色体: Chr07 坐标: 23812511-23816627 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002513`
名称	SmilChr07G002513
描述	uncharacterized SmilChr07G002513
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	23812511 - 23816627 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993590`
GeneID	`130993590`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993590`
原始查询	`SmilChr07G002513`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837599]; symbol=AT1G10580; hit=AT1G10580; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837599]; symbol=AT1G10580; hit=AT1G10580; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G10580` (AT1G10580) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837599] identity=79.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0397500` (OsWD40-74) - identity=73.8; qcov=0.956; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993590

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774508.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057774508.1`
3	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.60000	`XP_057774508.1`
4	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057774508.1`
5	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057774508.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:23814688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,D10
`Chr7:23815686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C23
`Chr7:23815708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D3
`Chr7:23815759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C23
`Chr7:23815779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D3
`Chr7:23816113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B89
`Chr7:23816278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774508.1

587 aa

294

587

WD40

PF00400 WD40 287-325 aa PF00400 WD40 330-368 aa PF00400 WD40 417-453 aa PF00400 WD40 508-544 aa PF00400 WD40 550-587 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774508.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	287	325	8.6e-43	143.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057774508.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	330	368	8.6e-43	143.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057774508.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	417	453	8.6e-43	143.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057774508.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	508	544	8.6e-43	143.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057774508.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	550	587	8.6e-43	143.7	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918525.1
ACGGCTCATCAAAAAAGAAAAAAGAAAACTAACAAAACGGGAGGTGCGACCGCGAGCCACAAAGGATTTGAAACCCCGAGATTGTTAAGTAGCCGCCATCAGTTCTTCCCCAATTTCCCTCTGATTTGGTTTCAACACTACCTGAGTTTCTTTTCACTAAACTAGCCGCCATCAATTCTATTCCCCTTATCTGATTTCATCTCTTTTCCGAATTTGTTTCACTAAACCCTATTTATTTCACTATTTTCTCTTTGATTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993590
ATGGATCTCCTGCAATCTTACAAAGATACCGACATGGAAGACGAGTCCTCATCGCCTCACCCGCCGGCATCCGAACCCGACCCCTCACCCGATTCGTCCCCGGTCCGGGCTCTTCCGGCCAAATCCGCGGCCCCGAAAGTTGACGACACAATGCTCTCACTTACCGTAGCCGGACAGGCCCAGTTTCAGGCGCAGAAGCCAATCGACCCTACCCAGCACCTCGTCTCCTTCAACCCCACCTACGACCAGCTGTGGGCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774508.1
MDLLQSYKDTDMEDESSSPHPPASEPDPSPDSSPVRALPAKSAAPKVDDTMLSLTVAGQAQFQAQKPIDPTQHLVSFNPTYDQLWAPILGPSHPYAKDGLAQGLRNHKLGFVENANIEPFVFDEQYNTFYKFGYAADPSENNYVGDVEGFKTNDGISVYNIPQHEQKKRKLEKKKEMLKENEESGEVDSTELENPSTDTWLMRNRKSPWAGKKDWVQGELTEEQKKYAEEHAKKKGEKEGGEREKGEAHVDKTTFHGKED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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