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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002514`

染色体: Chr07 坐标: 23829078-23830427 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002514`
名称	SmilChr07G002514
描述	uncharacterized SmilChr07G002514
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	23829078 - 23830427 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993990`
GeneID	`130993990`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993990`
原始查询	`SmilChr07G002514`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0439900` - identity=32.5; qcov=0.363; evalue=4.97e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993990

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775012.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775012.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775012.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057775012.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775012.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:23829083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:23829085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr7:23829102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A2,A5,B121,B124,B18,B48,B76,B8,C50,C58,C62
`Chr7:23829116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B46,B71,C34
`Chr7:23829135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A22,B102,B105,B110,B114,B117,B15,B35,B47,B56,B96,B99,C10,C22,C24,C52,C59,C65,C72,C9,D11,D6
`Chr7:23829142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A14,A19,B101,B105,B106,B108,B117,B118,B124,B126,B27,B51,B54,B7,B73,B79,B83,B84,B87,B91,B97,C14,C2,C20,C28,C3,C40,C70,C76,C81,C84,C9,D11,D2,D4,D9
`Chr7:23829166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C68,C71
`Chr7:23829188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B71
`Chr7:23829189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B91
`Chr7:23829189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:23829191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B71
`Chr7:23829207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	165	A1,A11,A15,A16,A19,A21,A23,A24,A25,A3,A6,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B108,B109,B11,B111,B112,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B137,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B21,B22,B24,B25,B27,B28,B29,B31,B34,B35,B40,B41,B42,B44,B45,B46,B47,B50,B51,B52,B53,B57,B59,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B79,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B89,B91,B94,B95,B98,C1,C12,C13,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C24,C26,C28,C29,C3,C30,C32,C34,C36,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C47,C49,C50,C52,C53,C54,C55,C59,C6,C60,C61,C62,C66,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D2,D5,D6,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775012.1

449 aa

224

449

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 3-45 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775012.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	3	45	3.6e-08	34.3	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919029.1
ATGTACACAGAGGGCATCAAGTGCCGAATATTCTCCACCACTCTGACTGGACCCGCCCAGTTGTGGTTTGGAACACTAGCCCCAAACTCCATTCATTCTTTCGAGGACTTGCAGACACGTTTTCTGAGACAATTCGCGAGCTCGCAAAGGGTAGGAAAGTCAGCTATCTCTTTGATGGACATAAAACAGGATCAAAATGAAACACTACGAGAATATACCACCCGGTTCAATCTCGCTGCTCTGGAGGTGCCAGAGGCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993990
ATGTACACAGAGGGCATCAAGTGCCGAATATTCTCCACCACTCTGACTGGACCCGCCCAGTTGTGGTTTGGAACACTAGCCCCAAACTCCATTCATTCTTTCGAGGACTTGCAGACACGTTTTCTGAGACAATTCGCGAGCTCGCAAAGGGTAGGAAAGTCAGCTATCTCTTTGATGGACATAAAACAGGATCAAAATGAAACACTACGAGAATATACCACCCGGTTCAATCTCGCTGCTCTGGAGGTGCCAGAGGCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775012.1
MYTEGIKCRIFSTTLTGPAQLWFGTLAPNSIHSFEDLQTRFLRQFASSQRVGKSAISLMDIKQDQNETLREYTTRFNLAALEVPEAESQIKNCAYVRGLKPGLFFDELQIRPARDFDDIMARLPGYLQLEDARMARKAENDKHKAKRAEAALEQNNRNQDRAPFRGLPPRVLPPQTEIPTHQQRTVNEVNRFIEYTPLNKPQEEIFHLLKNQPFFWAPSTYRDGQPQQGPNNKLCEYHNAYGHYTRYCGHLKHQLEFLVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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