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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002521`

染色体: Chr07 坐标: 23894230-23895540 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002521`
名称	SmilChr07G002521
描述	F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	23894230 - 23895540 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993597`
GeneID	`130993597`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993597`
原始查询	`SmilChr07G002521`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like
Arabidopsis	`AT1G23390` (AT1G23390) Kelch repeat-containing F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838947] identity=41.3; qcov=1.01; evalue=7.33e-88; confidence=medium
Rice	`Os09g0292900` (IBF1) - identity=29.7; qcov=1.03; evalue=1.39e-24; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993597

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774513.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057774513.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057774513.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774513.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774513.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:23894250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,C42,C50
`Chr7:23894415`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B99
`Chr7:23894415`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B99
`Chr7:23894484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B14,C28,C77,C79
`Chr7:23894498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B14,C28,C77,C79
`Chr7:23894746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr7:23894765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,C50
`Chr7:23894797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,C2,C45
`Chr7:23894867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr7:23894909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B38,B73,C49,C63
`Chr7:23894943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr7:23894959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B25,B26,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774513.1

377 aa

188

377

F-box-like

F-box

PF12937 F-box-like 21-53 aa PF00646 F-box 21-55 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774513.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	21	53	5.7e-06	26.7	F-box-like
`XP_057774513.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	21	55	1.5e-08	34.9	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918530.1
TTAGACATTTTGATAACCTTTTGAAAAATCAACCCAAAACAAGTAAACGTTTTACTACATTATAAATTAGCCCGCCAACCACAAGCCAGACATTTTCACAACTATAAAAATTTAAACACACCTAAGCAGACAGATATATTTGACCAGAAATATCCCAATTACCAATCTCAGAAATGGCAGCAAACACAGATCAACAAACGGCGGTGGAAGATGAAGATTTCAGATTTCATGCCGACGTATTGGAGAGCATCCTCTCGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993597
ATGGCAGCAAACACAGATCAACAAACGGCGGTGGAAGATGAAGATTTCAGATTTCATGCCGACGTATTGGAGAGCATCCTCTCGCACGTGCCGCTCGTCGACCTGGTCTCCGCCTCGCTCGTGTCGAAATCATGGAGTGACGCCGTATCCTCCTCCCTCCGCCACCACAACACGCCGCGGCCGTGGCTGGTTCTCCACGCGCAGGCACGGCACCCTCCGTACGCCACCGCGGTGCACGCGTACGATCCACGCTCCGGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774513.1
MAANTDQQTAVEDEDFRFHADVLESILSHVPLVDLVSASLVSKSWSDAVSSSLRHHNTPRPWLVLHAQARHPPYATAVHAYDPRSGIWIKIPQPPMDYIAGLKSSHSSFVYMFSPARFSFSSDPLNLEWHHVEPPLVWRQDPIVARVGDSVVVAGGGCDFEDEPLAVEIYDLNTRSWRICDSMPGNIRDSAASSWLSIAVAAEKLIVADKVSGQTHCFDPETNSWSGPFDLLIGESGSISSYNIGCANNSLVLIALCRIK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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