当前解析结果
SmilChr07G002529| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002529 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002529 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002529 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 23957320 - 23959273 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130993605 |
|---|---|
| GeneID | 130993605 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993605 |
| 原始查询 | SmilChr07G002529 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0587600- identity=66.7; qcov=0.095; evalue=8.31e-09; confidence=weak |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993605 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057774523.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057774523.1 |
| 3 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057774523.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774523.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774523.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:23958245 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A4,A8,B54,C52 |
Chr7:23958269 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B99,C21,C35,C40 |
Chr7:23958282 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B93,D11 |
Chr7:23958283 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A23 |
Chr7:23958287 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B46 |
Chr7:23958305 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr7:23958306 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B72,D10 |
Chr7:23958320 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr7:23958327 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B105,B15,B38,B75 |
Chr7:23958333 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C34,C66 |
Chr7:23958336 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,B25,B90,C31 |
Chr7:23958337 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。