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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002530`

染色体: Chr07 坐标: 23971747-23975987 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002530`
名称	SmilChr07G002530
描述	probable BOI-related E3 ubiquitin-protein ligase 3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	23971747 - 23975987 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993608`
GeneID	`130993608`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993608`
原始查询	`SmilChr07G002530`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable BOI-related E3 ubiquitin-protein ligase 3
产物	probable BOI-related E3 ubiquitin-protein ligase 3
Arabidopsis	`AT1G10650` (AT1G10650) SBP (S-ribonuclease binding protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837608] identity=51.9; qcov=1.05; evalue=8.12e-116; confidence=high
Rice	`Os02g0130300` - identity=36.8; qcov=0.767; evalue=1.85e-52; confidence=medium
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13920 (zf-C3HC4_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993608

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774525.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774525.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774525.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774525.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774525.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:23975216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C21
`Chr7:23975509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:23975511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:23975760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774525.1

340 aa

170

340

zf-C3HC4_3

PF13920 zf-C3HC4_3 291-329 aa

XP_057774526.1

326 aa

163

326

zf-C3HC4_3

PF13920 zf-C3HC4_3 277-315 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774525.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	291	329	5.9e-09	36.3	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057774526.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	277	315	5.6e-09	36.4	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918542.1
CTGGAGAAAAACAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGTTGGATGGGCGAGAGAATCATGAACTTCAAATGAATGAGTATTGAATATTGAACAGAGGAGCGTGTTTCCAGAAACCTGCCTTCTCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTTTAGAGTAGTGTTTATATCATGTGGGCCTCACTCAATTCGCTCTCGCGAACGTTTTCTTCTTCATCTGCTGATTCCTTTTTGCTCTGTTCTGCGCGCTTTTAATTTGTTGTAACAAACG...

XM_057918543.1
CAGGATAAGGAGGGGCTTAATCTTCTGGTTTTGAGAAGTAAATCAACTATATCAGTTTCTCAAATGTTCAGAGGTAACAACGGCAATACTGCTGCACCGTCTTTTCTTGAAAATCATCTTCAATATCCGGAAGATGTCTCAAATCAGCTGCAGTTTTGTGGAAATTTACCTGTAGAATTTCATGCTGATCCTGTAAATTATCTTGGAAGTAACAATGGCCCTCCATACCTCCTGCCAAATAAATGTGGCAGGGATGCTGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993608
ATGACCAGTTTAAGAAGTAAATCAACTATATCAGTTTCTCAAATGTTCAGAGGTAACAACGGCAATACTGCTGCACCGTCTTTTCTTGAAAATCATCTTCAATATCCGGAAGATGTCTCAAATCAGCTGCAGTTTTGTGGAAATTTACCTGTAGAATTTCATGCTGATCCTGTAAATTATCTTGGAAGTAACAATGGCCCTCCATACCTCCTGCCAAATAAATGTGGCAGGGATGCTGAAGCCATTCCCAGGCAGCAGAA...

LOC130993608
ATGTTCAGAGGTAACAACGGCAATACTGCTGCACCGTCTTTTCTTGAAAATCATCTTCAATATCCGGAAGATGTCTCAAATCAGCTGCAGTTTTGTGGAAATTTACCTGTAGAATTTCATGCTGATCCTGTAAATTATCTTGGAAGTAACAATGGCCCTCCATACCTCCTGCCAAATAAATGTGGCAGGGATGCTGAAGCCATTCCCAGGCAGCAGAAACTTCTGTTTTCCTTAAACAATAATACTTCAAATGATGAATC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774525.1
MTSLRSKSTISVSQMFRGNNGNTAAPSFLENHLQYPEDVSNQLQFCGNLPVEFHADPVNYLGSNNGPPYLLPNKCGRDAEAIPRQQKLLFSLNNNTSNDESERKASTLNLNPVSTGLRLSYDDEERNSSITSASGSLTAASSVFPYLSNDIKRELDQQKEELNHFIRTQEANMVKGVRDMRHRHMASFVTAIEKGVSRKLREKDAELETITRRNKELVESMKQVTSEAQNWCYMAKYNESIVNVLKTNLEQAMQGSNAGK...

XP_057774526.1
MFRGNNGNTAAPSFLENHLQYPEDVSNQLQFCGNLPVEFHADPVNYLGSNNGPPYLLPNKCGRDAEAIPRQQKLLFSLNNNTSNDESERKASTLNLNPVSTGLRLSYDDEERNSSITSASGSLTAASSVFPYLSNDIKRELDQQKEELNHFIRTQEANMVKGVRDMRHRHMASFVTAIEKGVSRKLREKDAELETITRRNKELVESMKQVTSEAQNWCYMAKYNESIVNVLKTNLEQAMQGSNAGKEGCGESDVDDAASC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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