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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002533`

染色体: Chr07 坐标: 24025575-24027697 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002533`
名称	SmilChr07G002533
描述	1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase, peroxisomal-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	24025575 - 24027697 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993610`
GeneID	`130993610`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993610`
原始查询	`SmilChr07G002533`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase, peroxisomal-like
产物	1%2C4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase%2C peroxisomal-like
Arabidopsis	`AT1G60550` (ECHID) enoyl-CoA hydratase/isomerase D [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842350] identity=74.8; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0662700` - identity=77; qcov=0.869; evalue=1.41e-172; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0008935 (1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase activity); GO:0009234 (menaquinone biosynthetic process)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00378 (ECH_1); PF16113 (ECH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993610

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057774529.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057774529.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774529.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774529.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774529.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:24025783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr7:24025827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,C30,C57,C86,D9
`Chr7:24025887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,C11,C54,C69
`Chr7:24026669`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B136
`Chr7:24026669`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B136
`Chr7:24027129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B6,B99,C15,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774529.1

335 aa

168

335

ECH_1

ECH_2

PF00378 ECH_1 81-329 aa PF16113 ECH_2 86-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774529.1`	Pfam	`PF00378`	ECH_1	Domain	81	329	1.3e-73	248.1	Enoyl-CoA hydratase/isomerase
`XP_057774529.1`	Pfam	`PF16113`	ECH_2	Domain	86	262	7.3e-21	75.7	Enoyl-CoA hydratase/isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918546.1
GCCTCTATAGTTATATGCTATAAATGTAGGAGTTGGCGAAGCAAGTTTACATAGCTCAAACTTGTCTACTAATTACTACTCTAATCCAATTCCTCCTCCCATGGCATTTGGAATGACTGATAAAGATATTGAGAGTATCAACAGGCGAATGGCCTCTGTTTCCGGGCATCTCATTCCGGCCGGATTCCACGACGGGAACGATAACGTCGCCTTGTCCAATTGCAGCTCCGGGATGGATGACACCTACCACCGCGTGCACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993610
ATGGCATTTGGAATGACTGATAAAGATATTGAGAGTATCAACAGGCGAATGGCCTCTGTTTCCGGGCATCTCATTCCGGCCGGATTCCACGACGGGAACGATAACGTCGCCTTGTCCAATTGCAGCTCCGGGATGGATGACACCTACCACCGCGTGCACGGTGAGGTTCCGACCTACATTCCTCAATGGAAGCCGGTATTTGACGATCCCGCCAACCCCTTCACCGATATTATCTATGAAAAAGCTGAAGGCATTGCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774529.1
MAFGMTDKDIESINRRMASVSGHLIPAGFHDGNDNVALSNCSSGMDDTYHRVHGEVPTYIPQWKPVFDDPANPFTDIIYEKAEGIAKITINRPERRNAFRPQTVKELMRAFNDARDDNSIGVIIFTGKGTKAFCSGGDQSFRGKEGYADYDSFGRLNVLDLQVQIRRLPKPVIAMVAGYAVGGGHVLHMVCDLTIAAENAIFGQTGPKVGSVDAGYGASVMDRLIGPKRAREMWFMARFYNAAEADKMGLVNTVVPLEKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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