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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002558`

染色体: Chr07 坐标: 24326561-24332015 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002558`
名称	SmilChr07G002558
描述	homeobox protein knotted-1-like 6
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	24326561 - 24332015 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993629`
GeneID	`130993629`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993629`
原始查询	`SmilChr07G002558`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox protein knotted-1-like 6
产物	homeobox protein knotted-1-like 6
Arabidopsis	`AT1G23380` (KNAT6) homeobox protein knotted-1-like 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838946] identity=55.2; qcov=1.03; evalue=1.19e-102; confidence=high
Rice	`Os01g0302500` (OSH6) - identity=52.8; qcov=0.759; evalue=3.2e-66; confidence=high
GO	GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain); PF03789 (ELK); PF03790 (KNOX1); PF03791 (KNOX2); PF05920 (Homeobox_KN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993629

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774570.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774570.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774570.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774570.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774570.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:24327556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B115,B124,B20
`Chr7:24331482`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C83
`Chr7:24331482`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C83
`Chr7:24331491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:24331500`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	C13,C3,C34,C56
`Chr7:24331500`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	C13,C3,C34,C56
`Chr7:24331567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:24331648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B34,B45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774570.1

307 aa

154

307

KNOX1

KNOX2

ELK

Homeobox_KN

Homeodomain

PF03790 KNOX1 83-123 aa PF03791 KNOX2 131-177 aa PF03789 ELK 204-224 aa PF05920 Homeobox_KN 243-282 aa PF00046 Homeodomain 250-283 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774570.1`	Pfam	`PF03790`	KNOX1	Family	83	123	9.8e-22	77.2	KNOX1 domain
`XP_057774570.1`	Pfam	`PF03791`	KNOX2	Family	131	177	5.1e-21	74.7	KNOX2 domain
`XP_057774570.1`	Pfam	`PF03789`	ELK	Family	204	224	8e-05	23.2	ELK domain
`XP_057774570.1`	Pfam	`PF05920`	Homeobox_KN	Family	243	282	1.1e-18	67.5	Homeobox KN domain
`XP_057774570.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	250	283	4.8e-07	30.2	Homeodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918587.1
AATCGGAAATTGTTGATAAATTAATAATGGAAAGAATGGGCCTCCCCCATCACTCACCCTCACCACCTGCACCTCACCTTCACCATCTCCATTCTTCCATTTTCTTCTCCACACACCTCCACGCTTTCCACCACCACTCCAACCGCCGCCGCCGCCGTTGCAGTACCGCACTCCCACACCCGATTAGCTCCTTAAAAATAAATACTAGGTATATATTATTATTTTCTTAAGAACACACACAAGAAAAGGATATATATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993629
ATGGATGAAATGTATGGGTTTGATTCGGCGGGAGATTACTATGTGGACAAGGCGCTGATGTCACCGGAGAATATGATGATGGCGGAGGAATACAATCAGTATCACTACCATTCTCCGATTAACTCCGGCGACAAGTACCATCATCGGATTCCGATGCTTGGTTCCGACGAATTGGGGTTCCAGAGCTCTGTTGTATCTCACGATTCAGCTTCTGTTAATGTCCAGAATCAAAGAGATGAGGATGAGATGAAGGCCAAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774570.1
MDEMYGFDSAGDYYVDKALMSPENMMMAEEYNQYHYHSPINSGDKYHHRIPMLGSDELGFQSSVVSHDSASVNVQNQRDEDEMKAKIASHPSYSKLLHAYIDCQKVGAPPEIVSVLDEMRRENPDTVSVCTELDPQLDEFMETYRHILVKYKSDLSRPFDEATSFLNEIQTQLLNLCNDEAAVWSDEELMEQQDAETKREDRLLKEKLVRMYGSHISSLKLEFSKKKKKGKLPKEGRQSLLAWWNLHSKWPYPTEADKIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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