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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002579`

染色体: Chr07 坐标: 24691717-24692485 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002579`
名称	SmilChr07G002579
描述	uncharacterized SmilChr07G002579
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	24691717 - 24692485 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994001`
GeneID	`130994001`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994001`
原始查询	`SmilChr07G002579`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=28.6; qcov=0.596; evalue=4.57e-11; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.1; qcov=0.861; evalue=1.02e-21; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994001

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775022.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057775022.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057775022.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057775022.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775022.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:24691858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A1,A7,B128,B16,B18,B29,B3,B60,B73,B86,C11,C36,C45,C50,C64,C80
`Chr7:24691902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr7:24691908`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	B118,B124,B13,B135,B31,B40,B58,B78,C23,C29,C51
`Chr7:24691910`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B118,B124,B13,B135,B31,B40,B58,B78,C23,C29,C51
`Chr7:24691934`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C61
`Chr7:24691934`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C61
`Chr7:24691937`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C61
`Chr7:24691937`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C61
`Chr7:24691946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B97,C61,D4
`Chr7:24691949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C50
`Chr7:24691952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr7:24691983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775022.1

223 aa

112

223

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 25-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775022.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	25	119	2.3e-20	73.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919039.1
ATGCGGAAGGTGGGAATGGGGGAGCTGGGTACTAAAGATGGGTGGGAATGGACAGAGACAGATGATGGCAAATTCACCACCAAATCTGCCTACGACGTAATCAAGTCAAGAAGAAACGAGAGTACTCACCACGCTGATGACAAGTGGAGAATGGCGGAGGTCTGGAAGACGCCCGCGCCTCATAAAGTCACGGTTACAACATGGAGATTACTTCGGAATCGTTTACCGACGTGTGACAATATTAGAAAGAGGGGAGTACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994001
ATGCGGAAGGTGGGAATGGGGGAGCTGGGTACTAAAGATGGGTGGGAATGGACAGAGACAGATGATGGCAAATTCACCACCAAATCTGCCTACGACGTAATCAAGTCAAGAAGAAACGAGAGTACTCACCACGCTGATGACAAGTGGAGAATGGCGGAGGTCTGGAAGACGCCCGCGCCTCATAAAGTCACGGTTACAACATGGAGATTACTTCGGAATCGTTTACCGACGTGTGACAATATTAGAAAGAGGGGAGTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775022.1
MRKVGMGELGTKDGWEWTETDDGKFTTKSAYDVIKSRRNESTHHADDKWRMAEVWKTPAPHKVTVTTWRLLRNRLPTCDNIRKRGVLLAEEDQACQHCNEQDENASHLFTTCTKTQEIWDEIQKWCGISMARPASTAMHWEMFGHCGKKKKIRKLLNMIWIGCVWMLWKKRNERIFEGKETIVGDFIQEIKARTWGWNRTFGVVDIDMNFVEWSANDLISRLV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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