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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002585`

染色体: Chr07 坐标: 24724410-24728713 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002585`
名称	SmilChr07G002585
描述	U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 homolog
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	24724410 - 24728713 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993654`
GeneID	`130993654`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993654`
原始查询	`SmilChr07G002585`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 homolog
产物	U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 homolog
Arabidopsis	`AT1G60170` (emb1220) pre-mRNA processing ribonucleoprotein binding region-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842312] identity=77.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0555400` (OsWD40-105) - identity=83.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000244 (spliceosomal tri-snRNP complex assembly); GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005687 (U4 snRNP); GO:0046540 (U4/U6 x U5 tri-snRNP complex); GO:0071011 (precatalytic spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01798 (Nop); PF09785 (Prp31_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993654

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774618.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057774618.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057774618.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774618.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774618.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:24725663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr7:24725665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B48,B84,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774618.1

482 aa

241

482

Nop

Prp31_C

PF01798 Nop 104-332 aa PF09785 Prp31_C 339-457 aa

XP_057774619.1

482 aa

241

482

Nop

Prp31_C

PF01798 Nop 104-332 aa PF09785 Prp31_C 339-457 aa

XP_057774620.1

482 aa

241

482

Nop

Prp31_C

PF01798 Nop 104-332 aa PF09785 Prp31_C 339-457 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774618.1`	Pfam	`PF01798`	Nop	Family	104	332	5.5e-74	249.2	snoRNA binding domain, fibrillarin
`XP_057774618.1`	Pfam	`PF09785`	Prp31_C	Family	339	457	5.1e-43	147.6	Prp31 C terminal domain
`XP_057774619.1`	Pfam	`PF01798`	Nop	Family	104	332	5.5e-74	249.2	snoRNA binding domain, fibrillarin
`XP_057774619.1`	Pfam	`PF09785`	Prp31_C	Family	339	457	5.1e-43	147.6	Prp31 C terminal domain
`XP_057774620.1`	Pfam	`PF01798`	Nop	Family	104	332	5.5e-74	249.2	snoRNA binding domain, fibrillarin
`XP_057774620.1`	Pfam	`PF09785`	Prp31_C	Family	339	457	5.1e-43	147.6	Prp31 C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918637.1
AATTAAATACACATAACTTCAAATCAAATAAAACTGAAATTGTGACTGTAGTCGGGAAACCCTCTCGCCTCTAAAAGCCTCCCCCGCCGCGCACACACACACCCTCTCGACTCGGTCGGCGCCGCCCTCACCCTCTACGCGGCACGGCAGCAGGCCTCCCGACCCTCTCCCCTCTCGGTCTGGACGCCTCTTCTTCCTCAGCTCCTCTAGCTTTCTGCTGTCATTCATAGGAATTCCGCTCTTTTTCTGGAGCAGTAGTC...

XM_057918635.1
GGTTTATGCTGCAAACTTGGGTATTATTTCTATTGATAATTTACGGATTTTATTGCTTTCGGTTCGATTCGGTTACCGATAAAAACCGCTCGATTTCGACCGATTCGATTTTGATCGATTGGTTCGATTCGAATGCTATAATTATCGGTTCAGTTTCAATTTGAGTGGATAGGATCGGTTCGGTATAGAATCGATGCAAGCGAGTGGCACTCACGCCCACGATCTAACCCGCCACGACTCGACCCGCGCTCAAGACTCGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130993654
ATGGCAACTCTTAATGACTCTTTTCTTGCTGATCTTGATGAACTGTCTGATAATGAAGATGATCTTCTGGAAGCAGAAAATGACAATGCTGAGCACATGGAAGAAGATATAGATGGTGATTTAGCTGATATAGAAGCACTTAACTATGACGATCTTGACAGTGTGTCCAAACTACAAAAAACTCAGCGGTATACTGACATCATGCAGAAAGTTGAAGATGCATTGGAAAAGGGGTCTGAGAACTCAAGTCATGGAATTGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057774618.1
MATLNDSFLADLDELSDNEDDLLEAENDNAEHMEEDIDGDLADIEALNYDDLDSVSKLQKTQRYTDIMQKVEDALEKGSENSSHGIVLEDDPEYQLIVDCNALSVDIENEIVIIHNFIRDKYRLKFPELESLVHHPIDYARVVKKIANEMDLTLVDLEGLLPSAIIMVVSVTASTTSGKPLPEDVLQKTIDACDRALALDSAKKKVLDFVESRMGYIAPNLSAIVGSAVAAKLIGTAGGLSALAKMPACNVQLLGAKKKN...

XP_057774619.1
MATLNDSFLADLDELSDNEDDLLEAENDNAEHMEEDIDGDLADIEALNYDDLDSVSKLQKTQRYTDIMQKVEDALEKGSENSSHGIVLEDDPEYQLIVDCNALSVDIENEIVIIHNFIRDKYRLKFPELESLVHHPIDYARVVKKIANEMDLTLVDLEGLLPSAIIMVVSVTASTTSGKPLPEDVLQKTIDACDRALALDSAKKKVLDFVESRMGYIAPNLSAIVGSAVAAKLIGTAGGLSALAKMPACNVQLLGAKKKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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