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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002592`

染色体: Chr07 坐标: 24923193-24926301 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002592`
名称	SmilChr07G002592
描述	uncharacterized SmilChr07G002592
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	24923193 - 24926301 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993661`
GeneID	`130993661`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993661`
原始查询	`SmilChr07G002592`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NHL domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843364]; symbol=AT1G70280; hit=AT1G70280; species=arabidopsis; confidence=high
产物	NHL domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843364]; symbol=AT1G70280; hit=AT1G70280; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G70280` (AT1G70280) NHL domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843364] identity=67.2; qcov=0.936; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0730400` - identity=59.5; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01436 (NHL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993661

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057774627.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057774627.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057774627.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774627.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774627.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:24923481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B132,C83
`Chr7:24923557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:24923746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:24923896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:24923980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C48
`Chr7:24924437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C83
`Chr7:24925097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:24925785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:24925889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,C14,D11
`Chr7:24926006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B48,B84,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774627.1

500 aa

250

500

NHL

PF01436 NHL 147-172 aa

XP_057774628.1

498 aa

249

498

NHL

PF01436 NHL 147-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774627.1`	Pfam	`PF01436`	NHL	Repeat	147	172	8.2e-09	35.8	NHL repeat
`XP_057774628.1`	Pfam	`PF01436`	NHL	Repeat	147	172	8.1e-09	35.8	NHL repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918644.1
AATTTAGGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCAACCGTCTCCCTTGTTTCTCTCTGTTTTGTCTCTTTCATCCCTTCTCTCTCCTCACTCCTCACTCACTCGCCCCTCAAAAAATCCTCGCTTTTCTCCTCCACCTTCCCTTTTCCTTTCATCCTTTTCCCATCAAGAATCTCTAAACCCACAAAGAAACCTTTCACTCCCCACCCTTTTTCTCTGCTAGGGTTTTCATTTTCAGGCAATGCCGACCTCCTCGCTCCGTTTCTGA...

XM_057918645.1
CAGCAGCAGTAGCAGCAACCGTCTCCCTTGTTTCTCTCTGTTTTGTCTCTTTCATCCCTTCTCTCTCCTCACTCCTCACTCACTCGCCCCTCAAAAAATCCTCGCTTTTCTCCTCCACCTTCCCTTTTCCTTTCATCCTTTTCCCATCAAGAATCTCTAAACCCACAAAGAAACCTTTCACTCCCCACCCTTTTTCTCTGCTAGGGTTTTCATTTTCAGGCAATGCCGACCTCCTCGCTCCGTTTCTGAGCTACTCCCAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993661
ATGCCGTTGAAAATGGGGAAAAATGCTGTTATGCTGCTTTTCACTCTTGTGCTCCTCTTTGGCGGCGTGTGCTGCATTTCTGCTCCTTCCTCACCTGCCAGAATTGTTAATGGAGTTTTCTCGAACGCATTTTCGATGCTGATGAAATGGGTTCTATCGCTCAAGGCCACAACTAAGACTGCCATTTCGGGGCGTCCGATGATGAAGTTCGAGGGCGGCTACAATGTGGAGACCGTGTTTGACGGCAGCAAGCTCGGAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774627.1
MPLKMGKNAVMLLFTLVLLFGGVCCISAPSSPARIVNGVFSNAFSMLMKWVLSLKATTKTAISGRPMMKFEGGYNVETVFDGSKLGIEPYAVEVLPDGDLLILDSANSNLYKIASSLSLYSRPRLVSGSGDGYYGHVDGKLREARMNHPKGLTVDDRGNIYIADTDNMAIRKISDTGVTTIAGGKRVRGGGHLDGPSEDAKFSNDFDVVYLGSSCSLLVIDRGNKAIREIQLNFDDCAYQYGSGFPLGIAVLVAAGFFGY...

XP_057774628.1
MPLKMGKNAVMLLFTLVLLFGGVCCISAPSSPARIVNGVFSNAFSMLMKWVLSLKATTKTAISGRPMMKFEGGYNVETVFDGSKLGIEPYAVEVLPDGDLLILDSANSNLYKIASSLSLYSRPRLVSGSGDGYYGHVDGKLREARMNHPKGLTVDDRGNIYIADTDNMAIRKISDTGVTTIAGGKRVRGGGHLDGPSEDAKFSNDFDVVYLGSSCSLLVIDRGNKAIREIQLNFDDCAYQYGSGFPLGIAVLVAAGFFGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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