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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002612`

染色体: Chr07 坐标: 25143553-25146981 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002612`
名称	SmilChr07G002612
描述	40S ribosomal protein S10-1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	25143553 - 25146981 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993677`
GeneID	`130993677`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993677`
原始查询	`SmilChr07G002612`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S10-1-like
产物	40S ribosomal protein S10-1-like
Arabidopsis	`AT4G25740` (AT4G25740) RNA binding Plectin/S10 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828679] identity=86.5; qcov=0.872; evalue=5.37e-87; confidence=high
Rice	`Os02g0549600` (RPS10a) - identity=85.5; qcov=0.888; evalue=3.47e-86; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03501 (S10_plectin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993677

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774663.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057774663.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057774663.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057774663.1`
5	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057774663.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:25144310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B62,C79
`Chr7:25144314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:25144322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C4
`Chr7:25144337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C4
`Chr7:25144400`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	53	A1,A10,A14,A19,A7,B10,B101,B107,B111,B112,B120,B122,B124,B131,B14,B17,B20,B22,B3,B30,B4,B45,B47,B49,B51,B60,B78,B85,B94,B97,B99,C17,C18,C27,C3,C33,C35,C36,C38,C44,C55,C56,C63,C64,C7,C72,C73,C79,C8,C84,D1,D4,D9
`Chr7:25144525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C33,C51
`Chr7:25146053`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	40	A15,A2,A22,A3,A6,B114,B120,B122,B128,B15,B18,B19,B23,B26,B28,B31,B33,B44,B58,B59,B63,B7,B70,B75,B81,B89,B90,B97,C14,C16,C26,C31,C44,C45,C57,C7,C76,C82,C86,D1
`Chr7:25146782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774663.1

179 aa

179

S10_plectin

PF03501 S10_plectin 3-94 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774663.1`	Pfam	`PF03501`	S10_plectin	Domain	3	94	3.6e-43	146.3	Plectin/S10 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918680.1
CTGTACATGGACATGAATGGAAGCAAAGTTGATGAATAGAGTTAAACTATCAATATCCCTCTGAATTAGCAAATTATCGGAACTCGAGTTTGTTTGTGTAAATAGATTTGTTTGTTGATAGATGGCTTTTCTTTTCTTATTTACACTATCGTGCCACTCATTATTTACTTAAATGAAGAAATTGCTAATTAATTCTAAAATCTGTATCCACTTCAAATAGAAGAGCAGTCAAATTTATTTGGGCTTCTCAGTTTATAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993677
ATGATTATTTCGGAGAAGAACAGGAGAGAGATCTCCAAGTACCTCTTTCAAGAGGGCGTGTGCTATGCGAAGAAGGATTTCAACCTAGCTAAGCACCCCGAGATCGATGTCCCAAATCTGCAGGTGATTAAGCTTATGCAGAGCTTCAAGTCGAAAGAGTACGTGCGTGAGACCTTTGCTTGGATGCACTACTATTGGTATCTGACAAATGATGGAATTGAATTCCTCCGCACATACCTCAACCTTCCATCAGAGATCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774663.1
MIISEKNRREISKYLFQEGVCYAKKDFNLAKHPEIDVPNLQVIKLMQSFKSKEYVRETFAWMHYYWYLTNDGIEFLRTYLNLPSEIVPATLKKSAKPLGRPMGGPPGDRPRGPPRFDGDRPRFGDRDGYRGGPRGPPGEFGGEKGGAPADFQPSFRGGNGGGRPGFGRGAGGFGGSPST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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