当前解析结果
SmilChr07G002634| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002634 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002634 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002634 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 25419877 - 25426978 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130993700 |
|---|---|
| GeneID | 130993700 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993700 |
| 原始查询 | SmilChr07G002634 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993700 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057774708.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057774708.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774708.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774708.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057774708.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:25426604 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B130,B7 |
Chr7:25426628 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B9 |
Chr7:25426628 |
CG |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B9 |
Chr7:25426630 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 46 | A19,A2,B10,B109,B115,B117,B124,B125,B128,B129,B133,B14,B140,B17,B2,B29,B30,B50,B54,B59,B66,B72,B76,B77,B79,B83,B89,B90,B92,B95,C13,C18,C2,C20,C21,C26,C36,C45,C46,C47,C50,C55,C59,C61,C8,C80 |
Chr7:25426644 |
ACT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A19 |
Chr7:25426644 |
ACT |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | A19 |
Chr7:25426845 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,B123,B19 |
Chr7:25426899 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A22,B26,B76,C49 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。