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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002638`

染色体: Chr07 坐标: 25481993-25483567 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002638`
名称	SmilChr07G002638
描述	protein JINGUBANG
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	25481993 - 25483567 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993703`
GeneID	`130993703`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993703`
原始查询	`SmilChr07G002638`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein JINGUBANG
产物	protein JINGUBANG
Arabidopsis	`AT1G24130` (AT1G24130) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839025] identity=59.1; qcov=0.94; evalue=1.47e-144; confidence=high
Rice	`Os02g0740900` (OsWD40-54) - identity=50; qcov=1.02; evalue=2.17e-122; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993703

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057774711.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057774711.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774711.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774711.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774711.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:25482306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:25482327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C6,C73,D3
`Chr7:25482693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:25482720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr7:25482738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:25482747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr7:25482765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr7:25482863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B48,B66,D5
`Chr7:25482906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:25483105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C30,C70
`Chr7:25483233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr7:25483235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B27,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774711.1

398 aa

199

398

WD40

PF00400 WD40 53-87 aa PF00400 WD40 172-204 aa PF00400 WD40 216-246 aa PF00400 WD40 257-292 aa PF00400 WD40 306-336 aa PF00400 WD40 345-390 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774711.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	53	87	1.7e-40	136.4	WD domain, G-beta repeat
`XP_057774711.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	172	204	1.7e-40	136.4	WD domain, G-beta repeat
`XP_057774711.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	216	246	1.7e-40	136.4	WD domain, G-beta repeat
`XP_057774711.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	257	292	1.7e-40	136.4	WD domain, G-beta repeat
`XP_057774711.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	306	336	1.7e-40	136.4	WD domain, G-beta repeat
`XP_057774711.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	345	390	1.7e-40	136.4	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918728.1
ATTGTTAGATGCGCCGAGACGCTAAAATGCGCAGTCCTAGTGCAAGCTGCCTCGAAACTCCTGGAGTGCGCTAGTCCACTCTCTTTATAAGCAACTTGAGCTCCCATACTCCACTGCCAAAAAATAAATTTCAATTTTATCCTCTCCTAAGAGAAATGATAAGATTTACTCATTGCTCTTCGCCTTCCCATTCCGACCAAGTCGAAGATTCCGATCCCTCCTCAAACTCCTCATCCCTCAGTTCTCAGCCGAGCCTCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993703
ATGATAAGATTTACTCATTGCTCTTCGCCTTCCCATTCCGACCAAGTCGAAGATTCCGATCCCTCCTCAAACTCCTCATCCCTCAGTTCTCAGCCGAGCCTCCCTTCAGTCCCCTCCCTAACCGACCTCCCTCCCTCCACCGCCACCCACCACCACTGCCTCGCCACCCTCAAGGGCCACTCCTCCTCAATCTTCTCGCTCTCCCTCGCCGGAAAGCACCTCTACAGCGGCGTTTCCGACGGCCAAATCCGCGTTTGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774711.1
MIRFTHCSSPSHSDQVEDSDPSSNSSSLSSQPSLPSVPSLTDLPPSTATHHHCLATLKGHSSSIFSLSLAGKHLYSGVSDGQIRVWDRNPSSYTDNGAVSESRSAVKSIVVSGDKLFTAHSDNKIRVWKIDNYSGDGRRCTAVAVLPTVSDRCMSLFSAKNYVKVRRHKRCTWVHHVDAVAALAATSDGALLYSVSWDRSFKIWRSSDFRCVESVQNAHDDAINAVVLSADGHVYTGSADRRIKVWRINGGDQKHSLVST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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