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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002663`

染色体: Chr07 坐标: 25843930-25846169 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002663`
名称	SmilChr07G002663
描述	glycosyltransferase family 92 protein RCOM_0530710-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	25843930 - 25846169 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993729`
GeneID	`130993729`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993729`
原始查询	`SmilChr07G002663`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycosyltransferase family 92 protein RCOM_0530710-like
产物	glycosyltransferase family 92 protein RCOM_0530710-like
Arabidopsis	`AT1G27200` (AT1G27200) glycosyltransferase family protein (DUF23) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839609] identity=52.4; qcov=0.937; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0121900` - identity=43.1; qcov=0.979; evalue=9.41e-145; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01697 (Glyco_transf_92)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993729

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057774752.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057774752.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774752.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774752.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774752.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:25844364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C8
`Chr7:25844613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B25
`Chr7:25844664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B86,C17
`Chr7:25844710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr7:25844716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C14
`Chr7:25844734`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	95	A13,A15,A16,A2,A3,A4,A5,A6,A9,B1,B100,B103,B104,B11,B111,B113,B119,B124,B134,B136,B138,B139,B140,B18,B24,B25,B26,B27,B28,B31,B34,B4,B41,B45,B46,B48,B51,B54,B59,B6,B60,B61,B68,B7,B70,B72,B73,B74,B77,B84,B85,B89,B9,B90,B92,B93,B98,C1,C14,C15,C16,C19,C21,C28,C29,C30,C33,C39,C40,C42,C44,C46,C52,C58,C60,C62,C63,C67,C7,C70,C72,C74,C78,C79,C80,C81,C82,C83,C84,C87,D11,D4,D5,D7,D8
`Chr7:25844751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B103
`Chr7:25844751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr7:25844767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:25844887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C82
`Chr7:25845000`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B126
`Chr7:25845000`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B126

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774752.1

574 aa

287

574

Glyco_transf_92

PF01697 Glyco_transf_92 282-518 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774752.1`	Pfam	`PF01697`	Glyco_transf_92	Domain	282	518	2.4e-34	119.8	Glycosyltransferase family 92

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918769.1
ATATTAGATGGATAGTTGAATTAGCACACAATACGTTTAAGACCAAACTCCAAGTAAGGAACATCAATGCAGCTGCAAAATACACCATTTATTACCGCCCTTCACTCCTCATCCCCATTTGCCCATTCTTTTCAAGGAAAGAAAAGTCCCATAAAGTAGAGAGAGAGAGAGAGTTCTATCTCCGACATTTACCAGATAACAGAACAGCAGCAACACACGCTAAAGTAAAAAAAAAAAAACGCACAACACAAGCACTGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993729
ATGAGCTCTTCAGATAAACGCCGCAAGAGAAAACGTATTCTGAGACAATCACTCTCACTCTCGTGTGTAAGATCTGTCCTCCTCTGCTTCAGCTTCCTCACACTGCTCTACCTCTTATCCTACGCTCTCCCCTTCACTTGTTCCGCTTTCCGCCCCGTTTTAGTCGTTTCTACCTTATCCTTGTTGTCTTCTTCCGCTACCACAACCGCCCACCTCTTGGACATTCAGGATAGGGTTTTGTTCCCCGATCATGTCCTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774752.1
MSSSDKRRKRKRILRQSLSLSCVRSVLLCFSFLTLLYLLSYALPFTCSAFRPVLVVSTLSLLSSSATTTAHLLDIQDRVLFPDHVLLLLTRANKDGARELECLYFSESDLIRGRNHSGVKKVLSIDEYDEFRMIVRCPLPFGNYSGEVNLRWHGENGISEQVKDSWSLNNWDNLAYAAAIDDTSVVVFVKGLNLRADRKSDPSQFSCHFALGKWKRTKALTAAQEVIRCALPRSLQVRGSNAHRVVEGIRVTIGMQQQLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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