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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002664`

染色体: Chr07 坐标: 25846118-25849625 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002664`
名称	SmilChr07G002664
描述	protein COFACTOR ASSEMBLY OF COMPLEX C SUBUNIT B CCB4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	25846118 - 25849625 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993730`
GeneID	`130993730`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993730`
原始查询	`SmilChr07G002664`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein COFACTOR ASSEMBLY OF COMPLEX C SUBUNIT B CCB4, chloroplastic
产物	protein COFACTOR ASSEMBLY OF COMPLEX C SUBUNIT B CCB4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G59840` (CCB4) cofactor assembly of complex C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842278] identity=63.8; qcov=0.972; evalue=1.04e-124; confidence=high
Rice	`Os04g0650500` - identity=60; qcov=0.914; evalue=4.67e-109; confidence=high
GO	GO:0009507 (chloroplast); GO:0010190 (cytochrome b6f complex assembly)
KEGG	-
Pfam	PF11152 (CCB2_CCB4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993730

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057774753.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057774753.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057774753.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.40000	`XP_057774753.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774753.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:25846837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr7:25847044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B37,B58,C78
`Chr7:25847788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr7:25847791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774753.1

290 aa

145

290

CCB2_CCB4

PF11152 CCB2_CCB4 61-271 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774753.1`	Pfam	`PF11152`	CCB2_CCB4	Family	61	271	1.5e-56	191.6	Cofactor assembly of complex C subunit B, CCB2/CCB4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091756.1
ATGTCAATTTTAATGGCACGGATGAAGCATATGGGATTTGCAGGGACTAAAGGTCTAGGCCGTGTTTGGACTTGATGATTTGTCGAAGAAAAAACAGAAAACTACACTAGCCGAAACTCAATGGACGCGGGAATCCTTCAGCGCTTCGTTATTCCGTTAAGCCCGCCACGCAACCGTTACGTTTCCCGCCCGCACCAAATTAGGGTTTCTCTCAATTCTCAGGGAGGGTATGAAGCTCCGAAGCCAAAGAGGGAGCTGCT...

XM_057918770.1
CAGGGACTAAAGGTCTAGGCCGTGTTTGGACTTGATGATTTGTCGAAGAAAAAACAGAAAACTACACTAGCCGAAACTCAATGGACGCGGGAATCCTTCAGCGCTTCGTTATTCCGTTAAGCCCGCCACGCAACCGTTACGTTTCCCGCCCGCACCAAATTAGGGTTTCTCTCAATTCTCAGGGAGGGTATGAAGCTCCGAAGCCAAAGAGGGAGCTGCTGGCGGAATGGGTGTCTAAAAACGACGATTTCGTGCGGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993730
ATGGACGCGGGAATCCTTCAGCGCTTCGTTATTCCGTTAAGCCCGCCACGCAACCGTTACGTTTCCCGCCCGCACCAAATTAGGGTTTCTCTCAATTCTCAGGGAGGGTATGAAGCTCCGAAGCCAAAGAGGGAGCTGCTGGCGGAATGGGTGTCTAAAAACGACGATTTCGTGCGGAGCTTGCCGATATACGTCGGCGGCGCATCTCTGGCGGCTGTGCTCCTCAATCGAGCGGTTTCGGGCATTGCTCCTGTTGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774753.1
MDAGILQRFVIPLSPPRNRYVSRPHQIRVSLNSQGGYEAPKPKRELLAEWVSKNDDFVRSLPIYVGGASLAAVLLNRAVSGIAPVADASSSQSRADLLTLGLAVTNILNGLVWLSIRPKTISVVDPNGVECQRIYHGLPESVTSELLWAWESISDVTCCRSLIVVYDGICILQIGFADVLQPNGDEPTVVDANKLIQGSLYKGVLRSGSQSYLANLSLYPGKTELPFLPSNTQAVIMQPLGDKGIAIVGGDTIRGFTTSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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