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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002671`

染色体: Chr07 坐标: 25989038-25991048 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002671`
名称	SmilChr07G002671
描述	probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 12
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	25989038 - 25991048 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993736`
GeneID	`130993736`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993736`
原始查询	`SmilChr07G002671`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 12
产物	probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 12
Arabidopsis	`AT2G26440` (AT2G26440) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817184] identity=66; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0193200` (OsPME19) - identity=45.2; qcov=1; evalue=2.02e-154; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993736

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057774759.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057774759.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774759.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774759.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774759.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:25989730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr7:25990042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B64,C16
`Chr7:25990152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B98,C48
`Chr7:25990213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:25990255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:25990260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,A25,B129,C25
`Chr7:25990347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr7:25990603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,A25,C25
`Chr7:25990693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B26,B89,C69,D8
`Chr7:25990701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr7:25990789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B26,B89,C69,D8
`Chr7:25990908`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A13,A15,A18,A2,A25,A3,A4,A6,A7,B10,B129,B13,B135,B14,B2,B33,B34,B48,B49,B57,B66,B69,B70,C23,C25,C29,C54,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774759.1

535 aa

268

535

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 36-182 aa PF01095 Pectinesterase 227-520 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774759.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	36	182	4.3e-21	76.4	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057774759.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	227	520	7e-137	455.8	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918776.1
TCGAGTGAGGCAGAAGTAAATGACAAAGCAACATTTATTTTCACAGAATCTGATGTTTGAATGTTAATAACTCCCACAAATTTATTACTCCAAAATTCAACTCTTTGAAATAACTAAGAATCTGGATTTTCTCTCTGATGTTTGGTTCCATGGCTTCCACCTCTCTCAAGTGTCTCCTCCTCTTCCTTTCTCTCTCTACAATTTCCGCTCTGAATCCCAATTCCACACAGTCCCATCTCTCCTCACTCAACCAGCTCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993736
ATGTTTGGTTCCATGGCTTCCACCTCTCTCAAGTGTCTCCTCCTCTTCCTTTCTCTCTCTACAATTTCCGCTCTGAATCCCAATTCCACACAGTCCCATCTCTCCTCACTCAACCAGCTCTGCAAATCCGCGCCATACCCAAATGCCTGCTTCGATTCCCTCAAGCTCTCTCTCTCCATCAACATCTCCCCCAACATTCTCTCTCTCCTCCTGCAATCCCTCTCCGCCGCCTTATCCCAAGGCCCACATCTCTCATCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774759.1
MFGSMASTSLKCLLLFLSLSTISALNPNSTQSHLSSLNQLCKSAPYPNACFDSLKLSLSINISPNILSLLLQSLSAALSQGPHLSSLLSTAGGANLVEKQRGAIQDCRELHRITLSSLNKSISRLPAADSNKLADARAFLSAAMTNKITCLEGLDSATGPMKAPLLDSISAIYMQVSNALSMLSKPGVRRGGNNRRRLLGFPRWLSRKARRVLQSSGDEYDPSQVLTVAADGTGNFTTLSDAINFAPNNSIDRVIIYVKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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