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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002706`

染色体: Chr07 坐标: 26432701-26434412 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002706`
名称	SmilChr07G002706
描述	homeobox-leucine zipper protein HAT5-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	26432701 - 26434412 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995719`
GeneID	`130995719`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995719`
原始查询	`SmilChr07G002706`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox-leucine zipper protein HAT5-like
产物	homeobox-leucine zipper protein HAT5-like
Arabidopsis	`AT3G01470` (HB-1) homeobox 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821138] identity=64.8; qcov=0.417; evalue=1.04e-42; confidence=low
Rice	`Os02g0729700` (Oshox16) - identity=59.3; qcov=0.456; evalue=9.1e-40; confidence=medium
GO	GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain); PF02183 (HALZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995719

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777098.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777098.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777098.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777098.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777098.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:26432904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:26433006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B91,C13,C28,C73,D3
`Chr7:26433082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr7:26433084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B86,C17
`Chr7:26433092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B112,B124,B20,C65
`Chr7:26433428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B112,B124,B20,C65
`Chr7:26433908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777098.1

259 aa

130

259

Homeodomain

HALZ

PF00046 Homeodomain 71-124 aa PF02183 HALZ 126-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777098.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	71	124	7.2e-17	61.7	Homeodomain
`XP_057777098.1`	Pfam	`PF02183`	HALZ	Coiled-coil	126	167	2e-14	54.2	Homeobox associated leucine zipper

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921115.1
AAGAAAGTTGAAGGGCAATTTAGTAATAGCAGCAACACGAGTTCCACCCCAACAAGTAACAGGCATTGTTATAATCCCCATCGAGCTATCAGGCTCCTCTTCCCATACAAGAATCTCTTTCTCTCTCCTCTGCATAGTTTTCTTCACTCCAAATCATCACGCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCTTTCTCGTCTGCTCGCTCTTCTGCTGACTGATGATGGGTCTGAGCCCTCCTCACTCCTGCATTTCCCTCGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995719
ATGGAGGGTGGAGGGGTTTACGACGATTCCCGCATGCCTAATCTTTTGCTCAAGAGTGAGAGTTCCGAGGTTCTTGATTCTCTCTGGGTTCCCAATTCTTCCCCTTCTTTTCAAGGCTCTGCATCGATGGTGAGCTTCGAAGGAGAAAACATAAACGTAAAAGCGGAAAACTGCAACGACGAATTTGACCCTTGCTTCCAGCAGCCGGAGAAGAAACGGCGGCTCTCTCACGATCAAGTTCAGTTTCTGGAAAAAAGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777098.1
MEGGGVYDDSRMPNLLLKSESSEVLDSLWVPNSSPSFQGSASMVSFEGENINVKAENCNDEFDPCFQQPEKKRRLSHDQVQFLEKSFEVENKLEPERKIQLAKEVGLQPRQVAIWFQNRRARYKTKVLEKEYAALKASYDKLTSDYDALFKENDNMRNQVNLLTEKLLMKSPSAKKEEAASSAVFDSESQSATLEPADSSHVEASDFSQDEDDTLSRSLMPPSCFPKLEIECYDDLQPNSCNLGFPVQDQVQGTWFWQY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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